Protein–RNA interactions for Protein: Q8N398

VWA5B2, von Willebrand factor A domain-containing protein 5B2, humanhuman

Predictions only

Length 1,253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA5B2Q8N398 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
VWA5B2Q8N398 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
VWA5B2Q8N398 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
VWA5B2Q8N398 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
VWA5B2Q8N398 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
VWA5B2Q8N398 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
VWA5B2Q8N398 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
VWA5B2Q8N398 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
VWA5B2Q8N398 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
VWA5B2Q8N398 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
VWA5B2Q8N398 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
VWA5B2Q8N398 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
VWA5B2Q8N398 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
VWA5B2Q8N398 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
VWA5B2Q8N398 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
VWA5B2Q8N398 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
VWA5B2Q8N398 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
VWA5B2Q8N398 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
VWA5B2Q8N398 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
VWA5B2Q8N398 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
VWA5B2Q8N398 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
VWA5B2Q8N398 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
VWA5B2Q8N398 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
VWA5B2Q8N398 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
VWA5B2Q8N398 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
VWA5B2Q8N398 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
VWA5B2Q8N398 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
VWA5B2Q8N398 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
VWA5B2Q8N398 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
VWA5B2Q8N398 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
VWA5B2Q8N398 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
VWA5B2Q8N398 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
VWA5B2Q8N398 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
VWA5B2Q8N398 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
VWA5B2Q8N398 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
VWA5B2Q8N398 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
VWA5B2Q8N398 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
VWA5B2Q8N398 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
VWA5B2Q8N398 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
VWA5B2Q8N398 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
VWA5B2Q8N398 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
VWA5B2Q8N398 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
VWA5B2Q8N398 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
VWA5B2Q8N398 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
VWA5B2Q8N398 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
VWA5B2Q8N398 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
VWA5B2Q8N398 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
VWA5B2Q8N398 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
VWA5B2Q8N398 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
VWA5B2Q8N398 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
VWA5B2Q8N398 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
VWA5B2Q8N398 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
VWA5B2Q8N398 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
VWA5B2Q8N398 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
VWA5B2Q8N398 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
VWA5B2Q8N398 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
VWA5B2Q8N398 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
VWA5B2Q8N398 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
VWA5B2Q8N398 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
VWA5B2Q8N398 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
VWA5B2Q8N398 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
VWA5B2Q8N398 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
VWA5B2Q8N398 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
VWA5B2Q8N398 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
VWA5B2Q8N398 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
VWA5B2Q8N398 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
VWA5B2Q8N398 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
VWA5B2Q8N398 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
VWA5B2Q8N398 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
VWA5B2Q8N398 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
VWA5B2Q8N398 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
VWA5B2Q8N398 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
VWA5B2Q8N398 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
VWA5B2Q8N398 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
VWA5B2Q8N398 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
VWA5B2Q8N398 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
VWA5B2Q8N398 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
VWA5B2Q8N398 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
VWA5B2Q8N398 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
VWA5B2Q8N398 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
VWA5B2Q8N398 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
VWA5B2Q8N398 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
VWA5B2Q8N398 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
VWA5B2Q8N398 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
VWA5B2Q8N398 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
VWA5B2Q8N398 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
VWA5B2Q8N398 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
VWA5B2Q8N398 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
VWA5B2Q8N398 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
VWA5B2Q8N398 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
VWA5B2Q8N398 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
VWA5B2Q8N398 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
VWA5B2Q8N398 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
VWA5B2Q8N398 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
VWA5B2Q8N398 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
VWA5B2Q8N398 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
VWA5B2Q8N398 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
VWA5B2Q8N398 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
VWA5B2Q8N398 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
VWA5B2Q8N398 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms