Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYE1

CCDC13, Coiled-coil domain-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC13Q8IYE1 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC13Q8IYE1 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC13Q8IYE1 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC13Q8IYE1 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC13Q8IYE1 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC13Q8IYE1 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC13Q8IYE1 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC13Q8IYE1 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC13Q8IYE1 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC13Q8IYE1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC13Q8IYE1 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC13Q8IYE1 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC13Q8IYE1 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC13Q8IYE1 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC13Q8IYE1 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC13Q8IYE1 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC13Q8IYE1 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC13Q8IYE1 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC13Q8IYE1 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC13Q8IYE1 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC13Q8IYE1 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC13Q8IYE1 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC13Q8IYE1 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC13Q8IYE1 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC13Q8IYE1 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC13Q8IYE1 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC13Q8IYE1 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC13Q8IYE1 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC13Q8IYE1 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CCDC13Q8IYE1 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC13Q8IYE1 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC13Q8IYE1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC13Q8IYE1 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC13Q8IYE1 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CCDC13Q8IYE1 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
CCDC13Q8IYE1 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
CCDC13Q8IYE1 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC13Q8IYE1 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC13Q8IYE1 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC13Q8IYE1 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC13Q8IYE1 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC13Q8IYE1 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC13Q8IYE1 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC13Q8IYE1 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC13Q8IYE1 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC13Q8IYE1 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC13Q8IYE1 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC13Q8IYE1 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC13Q8IYE1 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC13Q8IYE1 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC13Q8IYE1 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC13Q8IYE1 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC13Q8IYE1 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC13Q8IYE1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC13Q8IYE1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC13Q8IYE1 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC13Q8IYE1 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC13Q8IYE1 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC13Q8IYE1 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC13Q8IYE1 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC13Q8IYE1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC13Q8IYE1 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC13Q8IYE1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC13Q8IYE1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CCDC13Q8IYE1 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CCDC13Q8IYE1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC13Q8IYE1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC13Q8IYE1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC13Q8IYE1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC13Q8IYE1 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC13Q8IYE1 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC13Q8IYE1 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC13Q8IYE1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC13Q8IYE1 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC13Q8IYE1 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC13Q8IYE1 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC13Q8IYE1 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CCDC13Q8IYE1 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CCDC13Q8IYE1 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC13Q8IYE1 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC13Q8IYE1 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC13Q8IYE1 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC13Q8IYE1 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC13Q8IYE1 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC13Q8IYE1 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC13Q8IYE1 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC13Q8IYE1 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC13Q8IYE1 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC13Q8IYE1 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC13Q8IYE1 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC13Q8IYE1 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC13Q8IYE1 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC13Q8IYE1 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC13Q8IYE1 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC13Q8IYE1 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC13Q8IYE1 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC13Q8IYE1 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC13Q8IYE1 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC13Q8IYE1 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC13Q8IYE1 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms