Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWT1

SCN4B, Sodium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN4BQ8IWT1 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
SCN4BQ8IWT1 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SCN4BQ8IWT1 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SCN4BQ8IWT1 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SCN4BQ8IWT1 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SCN4BQ8IWT1 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SCN4BQ8IWT1 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SCN4BQ8IWT1 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SCN4BQ8IWT1 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SCN4BQ8IWT1 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SCN4BQ8IWT1 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SCN4BQ8IWT1 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SCN4BQ8IWT1 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SCN4BQ8IWT1 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SCN4BQ8IWT1 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SCN4BQ8IWT1 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SCN4BQ8IWT1 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SCN4BQ8IWT1 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SCN4BQ8IWT1 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SCN4BQ8IWT1 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SCN4BQ8IWT1 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SCN4BQ8IWT1 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SCN4BQ8IWT1 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SCN4BQ8IWT1 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
SCN4BQ8IWT1 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SCN4BQ8IWT1 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SCN4BQ8IWT1 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SCN4BQ8IWT1 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SCN4BQ8IWT1 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SCN4BQ8IWT1 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SCN4BQ8IWT1 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SCN4BQ8IWT1 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
SCN4BQ8IWT1 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SCN4BQ8IWT1 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SCN4BQ8IWT1 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
SCN4BQ8IWT1 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SCN4BQ8IWT1 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SCN4BQ8IWT1 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
SCN4BQ8IWT1 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SCN4BQ8IWT1 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SCN4BQ8IWT1 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SCN4BQ8IWT1 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SCN4BQ8IWT1 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SCN4BQ8IWT1 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SCN4BQ8IWT1 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SCN4BQ8IWT1 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SCN4BQ8IWT1 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SCN4BQ8IWT1 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SCN4BQ8IWT1 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
SCN4BQ8IWT1 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SCN4BQ8IWT1 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SCN4BQ8IWT1 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SCN4BQ8IWT1 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SCN4BQ8IWT1 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SCN4BQ8IWT1 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SCN4BQ8IWT1 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SCN4BQ8IWT1 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SCN4BQ8IWT1 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SCN4BQ8IWT1 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SCN4BQ8IWT1 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SCN4BQ8IWT1 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SCN4BQ8IWT1 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SCN4BQ8IWT1 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SCN4BQ8IWT1 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SCN4BQ8IWT1 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SCN4BQ8IWT1 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SCN4BQ8IWT1 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SCN4BQ8IWT1 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SCN4BQ8IWT1 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SCN4BQ8IWT1 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SCN4BQ8IWT1 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
SCN4BQ8IWT1 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SCN4BQ8IWT1 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SCN4BQ8IWT1 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SCN4BQ8IWT1 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SCN4BQ8IWT1 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SCN4BQ8IWT1 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SCN4BQ8IWT1 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SCN4BQ8IWT1 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SCN4BQ8IWT1 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SCN4BQ8IWT1 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SCN4BQ8IWT1 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SCN4BQ8IWT1 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SCN4BQ8IWT1 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SCN4BQ8IWT1 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SCN4BQ8IWT1 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SCN4BQ8IWT1 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SCN4BQ8IWT1 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SCN4BQ8IWT1 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
SCN4BQ8IWT1 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SCN4BQ8IWT1 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SCN4BQ8IWT1 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.2
SCN4BQ8IWT1 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
SCN4BQ8IWT1 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SCN4BQ8IWT1 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SCN4BQ8IWT1 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SCN4BQ8IWT1 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SCN4BQ8IWT1 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SCN4BQ8IWT1 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SCN4BQ8IWT1 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms