Protein–RNA interactions for Protein: Q86YS6

RAB43, Ras-related protein Rab-43, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB43Q86YS6 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RAB43Q86YS6 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RAB43Q86YS6 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RAB43Q86YS6 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RAB43Q86YS6 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RAB43Q86YS6 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RAB43Q86YS6 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RAB43Q86YS6 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
RAB43Q86YS6 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RAB43Q86YS6 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RAB43Q86YS6 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RAB43Q86YS6 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RAB43Q86YS6 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RAB43Q86YS6 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RAB43Q86YS6 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RAB43Q86YS6 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RAB43Q86YS6 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RAB43Q86YS6 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RAB43Q86YS6 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RAB43Q86YS6 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RAB43Q86YS6 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RAB43Q86YS6 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RAB43Q86YS6 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RAB43Q86YS6 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RAB43Q86YS6 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RAB43Q86YS6 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RAB43Q86YS6 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RAB43Q86YS6 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RAB43Q86YS6 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RAB43Q86YS6 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RAB43Q86YS6 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RAB43Q86YS6 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
RAB43Q86YS6 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RAB43Q86YS6 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
RAB43Q86YS6 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RAB43Q86YS6 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RAB43Q86YS6 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RAB43Q86YS6 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RAB43Q86YS6 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RAB43Q86YS6 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RAB43Q86YS6 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
RAB43Q86YS6 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RAB43Q86YS6 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RAB43Q86YS6 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RAB43Q86YS6 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RAB43Q86YS6 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
RAB43Q86YS6 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RAB43Q86YS6 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RAB43Q86YS6 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
RAB43Q86YS6 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RAB43Q86YS6 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RAB43Q86YS6 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RAB43Q86YS6 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RAB43Q86YS6 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RAB43Q86YS6 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RAB43Q86YS6 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RAB43Q86YS6 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RAB43Q86YS6 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RAB43Q86YS6 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RAB43Q86YS6 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RAB43Q86YS6 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RAB43Q86YS6 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
RAB43Q86YS6 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RAB43Q86YS6 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RAB43Q86YS6 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RAB43Q86YS6 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RAB43Q86YS6 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RAB43Q86YS6 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RAB43Q86YS6 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
RAB43Q86YS6 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RAB43Q86YS6 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RAB43Q86YS6 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RAB43Q86YS6 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RAB43Q86YS6 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RAB43Q86YS6 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
RAB43Q86YS6 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RAB43Q86YS6 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RAB43Q86YS6 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RAB43Q86YS6 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RAB43Q86YS6 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RAB43Q86YS6 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RAB43Q86YS6 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RAB43Q86YS6 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RAB43Q86YS6 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RAB43Q86YS6 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RAB43Q86YS6 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RAB43Q86YS6 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
RAB43Q86YS6 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RAB43Q86YS6 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RAB43Q86YS6 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RAB43Q86YS6 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RAB43Q86YS6 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RAB43Q86YS6 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RAB43Q86YS6 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RAB43Q86YS6 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RAB43Q86YS6 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RAB43Q86YS6 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RAB43Q86YS6 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RAB43Q86YS6 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RAB43Q86YS6 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.8 ms