Protein–RNA interactions for Protein: Q86YL7

PDPN, Podoplanin, humanhuman

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDPNQ86YL7 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDPNQ86YL7 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDPNQ86YL7 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDPNQ86YL7 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PDPNQ86YL7 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDPNQ86YL7 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDPNQ86YL7 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDPNQ86YL7 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDPNQ86YL7 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDPNQ86YL7 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDPNQ86YL7 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDPNQ86YL7 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDPNQ86YL7 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDPNQ86YL7 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDPNQ86YL7 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDPNQ86YL7 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDPNQ86YL7 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDPNQ86YL7 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDPNQ86YL7 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDPNQ86YL7 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDPNQ86YL7 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDPNQ86YL7 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDPNQ86YL7 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDPNQ86YL7 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PDPNQ86YL7 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PDPNQ86YL7 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDPNQ86YL7 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDPNQ86YL7 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDPNQ86YL7 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDPNQ86YL7 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDPNQ86YL7 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDPNQ86YL7 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDPNQ86YL7 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDPNQ86YL7 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDPNQ86YL7 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDPNQ86YL7 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDPNQ86YL7 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDPNQ86YL7 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDPNQ86YL7 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDPNQ86YL7 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDPNQ86YL7 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDPNQ86YL7 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDPNQ86YL7 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PDPNQ86YL7 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDPNQ86YL7 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDPNQ86YL7 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDPNQ86YL7 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDPNQ86YL7 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDPNQ86YL7 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDPNQ86YL7 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDPNQ86YL7 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDPNQ86YL7 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDPNQ86YL7 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDPNQ86YL7 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDPNQ86YL7 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDPNQ86YL7 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDPNQ86YL7 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDPNQ86YL7 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDPNQ86YL7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDPNQ86YL7 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDPNQ86YL7 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDPNQ86YL7 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDPNQ86YL7 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDPNQ86YL7 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDPNQ86YL7 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDPNQ86YL7 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDPNQ86YL7 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDPNQ86YL7 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDPNQ86YL7 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDPNQ86YL7 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDPNQ86YL7 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDPNQ86YL7 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PDPNQ86YL7 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDPNQ86YL7 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDPNQ86YL7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDPNQ86YL7 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDPNQ86YL7 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDPNQ86YL7 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDPNQ86YL7 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PDPNQ86YL7 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDPNQ86YL7 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDPNQ86YL7 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDPNQ86YL7 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDPNQ86YL7 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDPNQ86YL7 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDPNQ86YL7 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDPNQ86YL7 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDPNQ86YL7 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDPNQ86YL7 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDPNQ86YL7 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDPNQ86YL7 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDPNQ86YL7 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDPNQ86YL7 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDPNQ86YL7 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDPNQ86YL7 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDPNQ86YL7 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDPNQ86YL7 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDPNQ86YL7 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDPNQ86YL7 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDPNQ86YL7 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms