Protein–RNA interactions for Protein: Q86YH6

PDSS2, Decaprenyl-diphosphate synthase subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDSS2Q86YH6 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PDSS2Q86YH6 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PDSS2Q86YH6 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
PDSS2Q86YH6 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PDSS2Q86YH6 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PDSS2Q86YH6 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PDSS2Q86YH6 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PDSS2Q86YH6 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PDSS2Q86YH6 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PDSS2Q86YH6 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PDSS2Q86YH6 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PDSS2Q86YH6 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PDSS2Q86YH6 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PDSS2Q86YH6 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
PDSS2Q86YH6 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PDSS2Q86YH6 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PDSS2Q86YH6 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PDSS2Q86YH6 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PDSS2Q86YH6 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PDSS2Q86YH6 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PDSS2Q86YH6 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PDSS2Q86YH6 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PDSS2Q86YH6 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PDSS2Q86YH6 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PDSS2Q86YH6 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PDSS2Q86YH6 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PDSS2Q86YH6 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PDSS2Q86YH6 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PDSS2Q86YH6 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PDSS2Q86YH6 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PDSS2Q86YH6 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PDSS2Q86YH6 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PDSS2Q86YH6 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PDSS2Q86YH6 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PDSS2Q86YH6 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PDSS2Q86YH6 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PDSS2Q86YH6 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PDSS2Q86YH6 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PDSS2Q86YH6 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PDSS2Q86YH6 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PDSS2Q86YH6 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PDSS2Q86YH6 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PDSS2Q86YH6 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PDSS2Q86YH6 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PDSS2Q86YH6 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PDSS2Q86YH6 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PDSS2Q86YH6 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PDSS2Q86YH6 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PDSS2Q86YH6 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PDSS2Q86YH6 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PDSS2Q86YH6 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PDSS2Q86YH6 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
PDSS2Q86YH6 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PDSS2Q86YH6 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PDSS2Q86YH6 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PDSS2Q86YH6 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PDSS2Q86YH6 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PDSS2Q86YH6 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PDSS2Q86YH6 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PDSS2Q86YH6 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PDSS2Q86YH6 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PDSS2Q86YH6 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PDSS2Q86YH6 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PDSS2Q86YH6 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PDSS2Q86YH6 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PDSS2Q86YH6 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PDSS2Q86YH6 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PDSS2Q86YH6 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PDSS2Q86YH6 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PDSS2Q86YH6 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PDSS2Q86YH6 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PDSS2Q86YH6 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PDSS2Q86YH6 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PDSS2Q86YH6 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PDSS2Q86YH6 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PDSS2Q86YH6 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PDSS2Q86YH6 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PDSS2Q86YH6 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PDSS2Q86YH6 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PDSS2Q86YH6 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PDSS2Q86YH6 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PDSS2Q86YH6 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PDSS2Q86YH6 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
PDSS2Q86YH6 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PDSS2Q86YH6 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PDSS2Q86YH6 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PDSS2Q86YH6 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PDSS2Q86YH6 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PDSS2Q86YH6 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PDSS2Q86YH6 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
PDSS2Q86YH6 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PDSS2Q86YH6 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PDSS2Q86YH6 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
PDSS2Q86YH6 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
PDSS2Q86YH6 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PDSS2Q86YH6 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PDSS2Q86YH6 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PDSS2Q86YH6 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PDSS2Q86YH6 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PDSS2Q86YH6 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms