Protein–RNA interactions for Protein: Q6R6M4

USP17L2, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L2Q6R6M4 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
USP17L2Q6R6M4 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
USP17L2Q6R6M4 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC32.97■■■□□ 2.87
USP17L2Q6R6M4 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
USP17L2Q6R6M4 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC32.94■■■□□ 2.86
USP17L2Q6R6M4 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
USP17L2Q6R6M4 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
USP17L2Q6R6M4 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
USP17L2Q6R6M4 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
USP17L2Q6R6M4 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
USP17L2Q6R6M4 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
USP17L2Q6R6M4 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.9■■■□□ 2.86
USP17L2Q6R6M4 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
USP17L2Q6R6M4 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
USP17L2Q6R6M4 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC32.86■■■□□ 2.85
USP17L2Q6R6M4 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
USP17L2Q6R6M4 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
USP17L2Q6R6M4 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC32.81■■■□□ 2.84
USP17L2Q6R6M4 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
USP17L2Q6R6M4 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
USP17L2Q6R6M4 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
USP17L2Q6R6M4 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
USP17L2Q6R6M4 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.83
USP17L2Q6R6M4 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
USP17L2Q6R6M4 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
USP17L2Q6R6M4 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
USP17L2Q6R6M4 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
USP17L2Q6R6M4 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
USP17L2Q6R6M4 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
USP17L2Q6R6M4 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
USP17L2Q6R6M4 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
USP17L2Q6R6M4 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
USP17L2Q6R6M4 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
USP17L2Q6R6M4 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
USP17L2Q6R6M4 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.66■■■□□ 2.82
USP17L2Q6R6M4 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
USP17L2Q6R6M4 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
USP17L2Q6R6M4 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
USP17L2Q6R6M4 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
USP17L2Q6R6M4 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
USP17L2Q6R6M4 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
USP17L2Q6R6M4 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC32.55■■■□□ 2.8
USP17L2Q6R6M4 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
USP17L2Q6R6M4 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
USP17L2Q6R6M4 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
USP17L2Q6R6M4 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
USP17L2Q6R6M4 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
USP17L2Q6R6M4 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC32.5■■■□□ 2.79
USP17L2Q6R6M4 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
USP17L2Q6R6M4 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
USP17L2Q6R6M4 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
USP17L2Q6R6M4 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
USP17L2Q6R6M4 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
USP17L2Q6R6M4 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
USP17L2Q6R6M4 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
USP17L2Q6R6M4 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC32.45■■■□□ 2.79
USP17L2Q6R6M4 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
USP17L2Q6R6M4 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
USP17L2Q6R6M4 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
USP17L2Q6R6M4 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
USP17L2Q6R6M4 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
USP17L2Q6R6M4 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC32.42■■■□□ 2.78
USP17L2Q6R6M4 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
USP17L2Q6R6M4 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
USP17L2Q6R6M4 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
USP17L2Q6R6M4 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
USP17L2Q6R6M4 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
USP17L2Q6R6M4 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
USP17L2Q6R6M4 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC32.38■■■□□ 2.77
USP17L2Q6R6M4 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
USP17L2Q6R6M4 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
USP17L2Q6R6M4 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC32.36■■■□□ 2.77
USP17L2Q6R6M4 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
USP17L2Q6R6M4 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
USP17L2Q6R6M4 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC32.33■■■□□ 2.77
USP17L2Q6R6M4 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
USP17L2Q6R6M4 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
USP17L2Q6R6M4 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
USP17L2Q6R6M4 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
USP17L2Q6R6M4 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
USP17L2Q6R6M4 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
USP17L2Q6R6M4 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
USP17L2Q6R6M4 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
USP17L2Q6R6M4 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
USP17L2Q6R6M4 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
USP17L2Q6R6M4 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
USP17L2Q6R6M4 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
USP17L2Q6R6M4 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
USP17L2Q6R6M4 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
USP17L2Q6R6M4 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
USP17L2Q6R6M4 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
USP17L2Q6R6M4 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC32.21■■■□□ 2.75
USP17L2Q6R6M4 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
USP17L2Q6R6M4 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
USP17L2Q6R6M4 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
USP17L2Q6R6M4 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
USP17L2Q6R6M4 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC32.17■■■□□ 2.74
USP17L2Q6R6M4 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
USP17L2Q6R6M4 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
USP17L2Q6R6M4 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.2 ms