Protein–RNA interactions for Protein: Q68E01

INTS3, Integrator complex subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INTS3Q68E01 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
INTS3Q68E01 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC35.24■■■■□ 3.23
INTS3Q68E01 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
INTS3Q68E01 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
INTS3Q68E01 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
INTS3Q68E01 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC35.21■■■■□ 3.23
INTS3Q68E01 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
INTS3Q68E01 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
INTS3Q68E01 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.22
INTS3Q68E01 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
INTS3Q68E01 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
INTS3Q68E01 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
INTS3Q68E01 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
INTS3Q68E01 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC35.18■■■■□ 3.22
INTS3Q68E01 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.16■■■■□ 3.22
INTS3Q68E01 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
INTS3Q68E01 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
INTS3Q68E01 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
INTS3Q68E01 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
INTS3Q68E01 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
INTS3Q68E01 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
INTS3Q68E01 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
INTS3Q68E01 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
INTS3Q68E01 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC35.11■■■■□ 3.21
INTS3Q68E01 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC35.08■■■■□ 3.21
INTS3Q68E01 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
INTS3Q68E01 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
INTS3Q68E01 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
INTS3Q68E01 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
INTS3Q68E01 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
INTS3Q68E01 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
INTS3Q68E01 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
INTS3Q68E01 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC34.97■■■■□ 3.19
INTS3Q68E01 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC34.96■■■■□ 3.19
INTS3Q68E01 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC34.95■■■■□ 3.19
INTS3Q68E01 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
INTS3Q68E01 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
INTS3Q68E01 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
INTS3Q68E01 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
INTS3Q68E01 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC34.9■■■■□ 3.18
INTS3Q68E01 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.89■■■■□ 3.18
INTS3Q68E01 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC34.88■■■■□ 3.17
INTS3Q68E01 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
INTS3Q68E01 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
INTS3Q68E01 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
INTS3Q68E01 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
INTS3Q68E01 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.17
INTS3Q68E01 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
INTS3Q68E01 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
INTS3Q68E01 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
INTS3Q68E01 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
INTS3Q68E01 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
INTS3Q68E01 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC34.78■■■■□ 3.16
INTS3Q68E01 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC34.78■■■■□ 3.16
INTS3Q68E01 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC34.78■■■■□ 3.16
INTS3Q68E01 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC34.77■■■■□ 3.16
INTS3Q68E01 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
INTS3Q68E01 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
INTS3Q68E01 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
INTS3Q68E01 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC34.76■■■■□ 3.16
INTS3Q68E01 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC34.76■■■■□ 3.16
INTS3Q68E01 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
INTS3Q68E01 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
INTS3Q68E01 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
INTS3Q68E01 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
INTS3Q68E01 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
INTS3Q68E01 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
INTS3Q68E01 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
INTS3Q68E01 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC34.69■■■■□ 3.14
INTS3Q68E01 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC34.68■■■■□ 3.14
INTS3Q68E01 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.68■■■■□ 3.14
INTS3Q68E01 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
INTS3Q68E01 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
INTS3Q68E01 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
INTS3Q68E01 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
INTS3Q68E01 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
INTS3Q68E01 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
INTS3Q68E01 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
INTS3Q68E01 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
INTS3Q68E01 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC34.64■■■■□ 3.14
INTS3Q68E01 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
INTS3Q68E01 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC34.62■■■■□ 3.13
INTS3Q68E01 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
INTS3Q68E01 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
INTS3Q68E01 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
INTS3Q68E01 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC34.55■■■■□ 3.12
INTS3Q68E01 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
INTS3Q68E01 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
INTS3Q68E01 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
INTS3Q68E01 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
INTS3Q68E01 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
INTS3Q68E01 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC34.49■■■■□ 3.11
INTS3Q68E01 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
INTS3Q68E01 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
INTS3Q68E01 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
INTS3Q68E01 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
INTS3Q68E01 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC34.43■■■■□ 3.1
INTS3Q68E01 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
INTS3Q68E01 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC34.42■■■■□ 3.1
INTS3Q68E01 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms