Protein–RNA interactions for Protein: Q68D86

CCDC102B, Coiled-coil domain-containing protein 102B, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC102BQ68D86 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
CCDC102BQ68D86 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
CCDC102BQ68D86 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
CCDC102BQ68D86 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
CCDC102BQ68D86 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
CCDC102BQ68D86 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
CCDC102BQ68D86 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
CCDC102BQ68D86 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
CCDC102BQ68D86 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC34.07■■■■□ 3.04
CCDC102BQ68D86 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
CCDC102BQ68D86 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
CCDC102BQ68D86 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
CCDC102BQ68D86 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
CCDC102BQ68D86 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
CCDC102BQ68D86 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
CCDC102BQ68D86 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
CCDC102BQ68D86 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
CCDC102BQ68D86 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
CCDC102BQ68D86 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
CCDC102BQ68D86 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
CCDC102BQ68D86 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
CCDC102BQ68D86 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC33.95■■■■□ 3.03
CCDC102BQ68D86 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
CCDC102BQ68D86 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
CCDC102BQ68D86 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
CCDC102BQ68D86 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
CCDC102BQ68D86 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
CCDC102BQ68D86 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
CCDC102BQ68D86 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
CCDC102BQ68D86 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
CCDC102BQ68D86 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
CCDC102BQ68D86 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC33.84■■■■□ 3.01
CCDC102BQ68D86 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
CCDC102BQ68D86 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
CCDC102BQ68D86 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC33.83■■■■□ 3.01
CCDC102BQ68D86 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.82■■■■□ 3
CCDC102BQ68D86 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
CCDC102BQ68D86 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
CCDC102BQ68D86 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
CCDC102BQ68D86 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
CCDC102BQ68D86 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
CCDC102BQ68D86 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
CCDC102BQ68D86 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC33.77■■■■□ 3
CCDC102BQ68D86 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
CCDC102BQ68D86 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
CCDC102BQ68D86 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
CCDC102BQ68D86 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
CCDC102BQ68D86 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
CCDC102BQ68D86 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
CCDC102BQ68D86 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
CCDC102BQ68D86 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
CCDC102BQ68D86 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
CCDC102BQ68D86 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
CCDC102BQ68D86 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.98
CCDC102BQ68D86 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
CCDC102BQ68D86 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC33.66■■■□□ 2.98
CCDC102BQ68D86 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
CCDC102BQ68D86 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
CCDC102BQ68D86 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
CCDC102BQ68D86 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
CCDC102BQ68D86 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
CCDC102BQ68D86 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
CCDC102BQ68D86 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
CCDC102BQ68D86 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
CCDC102BQ68D86 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
CCDC102BQ68D86 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
CCDC102BQ68D86 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
CCDC102BQ68D86 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
CCDC102BQ68D86 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC33.55■■■□□ 2.96
CCDC102BQ68D86 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
CCDC102BQ68D86 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
CCDC102BQ68D86 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
CCDC102BQ68D86 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
CCDC102BQ68D86 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
CCDC102BQ68D86 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
CCDC102BQ68D86 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
CCDC102BQ68D86 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
CCDC102BQ68D86 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC33.48■■■□□ 2.95
CCDC102BQ68D86 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
CCDC102BQ68D86 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
CCDC102BQ68D86 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
CCDC102BQ68D86 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
CCDC102BQ68D86 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
CCDC102BQ68D86 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
CCDC102BQ68D86 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
CCDC102BQ68D86 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
CCDC102BQ68D86 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
CCDC102BQ68D86 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
CCDC102BQ68D86 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.4■■■□□ 2.94
CCDC102BQ68D86 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
CCDC102BQ68D86 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
CCDC102BQ68D86 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
CCDC102BQ68D86 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
CCDC102BQ68D86 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
CCDC102BQ68D86 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
CCDC102BQ68D86 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
CCDC102BQ68D86 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
CCDC102BQ68D86 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
CCDC102BQ68D86 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
CCDC102BQ68D86 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms