Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWJ9

SNX30, Sorting nexin-30, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX30Q5VWJ9 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SNX30Q5VWJ9 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
SNX30Q5VWJ9 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SNX30Q5VWJ9 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
SNX30Q5VWJ9 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SNX30Q5VWJ9 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SNX30Q5VWJ9 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SNX30Q5VWJ9 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SNX30Q5VWJ9 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SNX30Q5VWJ9 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SNX30Q5VWJ9 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SNX30Q5VWJ9 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SNX30Q5VWJ9 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SNX30Q5VWJ9 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SNX30Q5VWJ9 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SNX30Q5VWJ9 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SNX30Q5VWJ9 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SNX30Q5VWJ9 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SNX30Q5VWJ9 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SNX30Q5VWJ9 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SNX30Q5VWJ9 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SNX30Q5VWJ9 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SNX30Q5VWJ9 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
SNX30Q5VWJ9 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SNX30Q5VWJ9 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SNX30Q5VWJ9 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SNX30Q5VWJ9 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SNX30Q5VWJ9 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SNX30Q5VWJ9 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
SNX30Q5VWJ9 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
SNX30Q5VWJ9 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
SNX30Q5VWJ9 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SNX30Q5VWJ9 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SNX30Q5VWJ9 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SNX30Q5VWJ9 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SNX30Q5VWJ9 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SNX30Q5VWJ9 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
SNX30Q5VWJ9 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SNX30Q5VWJ9 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SNX30Q5VWJ9 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SNX30Q5VWJ9 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SNX30Q5VWJ9 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SNX30Q5VWJ9 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SNX30Q5VWJ9 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SNX30Q5VWJ9 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SNX30Q5VWJ9 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SNX30Q5VWJ9 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SNX30Q5VWJ9 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SNX30Q5VWJ9 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
SNX30Q5VWJ9 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SNX30Q5VWJ9 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SNX30Q5VWJ9 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SNX30Q5VWJ9 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SNX30Q5VWJ9 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SNX30Q5VWJ9 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SNX30Q5VWJ9 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SNX30Q5VWJ9 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SNX30Q5VWJ9 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SNX30Q5VWJ9 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SNX30Q5VWJ9 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SNX30Q5VWJ9 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SNX30Q5VWJ9 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SNX30Q5VWJ9 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SNX30Q5VWJ9 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SNX30Q5VWJ9 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SNX30Q5VWJ9 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SNX30Q5VWJ9 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SNX30Q5VWJ9 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SNX30Q5VWJ9 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SNX30Q5VWJ9 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SNX30Q5VWJ9 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SNX30Q5VWJ9 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SNX30Q5VWJ9 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SNX30Q5VWJ9 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SNX30Q5VWJ9 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SNX30Q5VWJ9 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SNX30Q5VWJ9 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SNX30Q5VWJ9 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SNX30Q5VWJ9 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SNX30Q5VWJ9 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SNX30Q5VWJ9 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SNX30Q5VWJ9 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SNX30Q5VWJ9 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SNX30Q5VWJ9 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SNX30Q5VWJ9 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SNX30Q5VWJ9 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SNX30Q5VWJ9 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SNX30Q5VWJ9 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SNX30Q5VWJ9 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SNX30Q5VWJ9 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SNX30Q5VWJ9 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SNX30Q5VWJ9 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SNX30Q5VWJ9 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SNX30Q5VWJ9 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SNX30Q5VWJ9 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SNX30Q5VWJ9 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SNX30Q5VWJ9 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SNX30Q5VWJ9 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
SNX30Q5VWJ9 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SNX30Q5VWJ9 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms