Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTM2

AGAP9, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP9Q5VTM2 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
AGAP9Q5VTM2 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
AGAP9Q5VTM2 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
AGAP9Q5VTM2 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
AGAP9Q5VTM2 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
AGAP9Q5VTM2 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
AGAP9Q5VTM2 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
AGAP9Q5VTM2 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
AGAP9Q5VTM2 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
AGAP9Q5VTM2 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
AGAP9Q5VTM2 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
AGAP9Q5VTM2 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
AGAP9Q5VTM2 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
AGAP9Q5VTM2 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
AGAP9Q5VTM2 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
AGAP9Q5VTM2 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
AGAP9Q5VTM2 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
AGAP9Q5VTM2 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
AGAP9Q5VTM2 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
AGAP9Q5VTM2 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
AGAP9Q5VTM2 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
AGAP9Q5VTM2 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
AGAP9Q5VTM2 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
AGAP9Q5VTM2 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
AGAP9Q5VTM2 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
AGAP9Q5VTM2 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
AGAP9Q5VTM2 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
AGAP9Q5VTM2 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
AGAP9Q5VTM2 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
AGAP9Q5VTM2 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
AGAP9Q5VTM2 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
AGAP9Q5VTM2 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
AGAP9Q5VTM2 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
AGAP9Q5VTM2 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
AGAP9Q5VTM2 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
AGAP9Q5VTM2 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
AGAP9Q5VTM2 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
AGAP9Q5VTM2 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
AGAP9Q5VTM2 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
AGAP9Q5VTM2 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
AGAP9Q5VTM2 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
AGAP9Q5VTM2 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
AGAP9Q5VTM2 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
AGAP9Q5VTM2 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
AGAP9Q5VTM2 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
AGAP9Q5VTM2 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
AGAP9Q5VTM2 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
AGAP9Q5VTM2 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
AGAP9Q5VTM2 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
AGAP9Q5VTM2 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
AGAP9Q5VTM2 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
AGAP9Q5VTM2 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
AGAP9Q5VTM2 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
AGAP9Q5VTM2 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
AGAP9Q5VTM2 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
AGAP9Q5VTM2 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
AGAP9Q5VTM2 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
AGAP9Q5VTM2 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
AGAP9Q5VTM2 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
AGAP9Q5VTM2 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
AGAP9Q5VTM2 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
AGAP9Q5VTM2 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
AGAP9Q5VTM2 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
AGAP9Q5VTM2 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
AGAP9Q5VTM2 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
AGAP9Q5VTM2 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
AGAP9Q5VTM2 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
AGAP9Q5VTM2 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
AGAP9Q5VTM2 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
AGAP9Q5VTM2 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
AGAP9Q5VTM2 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
AGAP9Q5VTM2 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
AGAP9Q5VTM2 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
AGAP9Q5VTM2 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
AGAP9Q5VTM2 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
AGAP9Q5VTM2 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
AGAP9Q5VTM2 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
AGAP9Q5VTM2 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
AGAP9Q5VTM2 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
AGAP9Q5VTM2 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
AGAP9Q5VTM2 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
AGAP9Q5VTM2 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
AGAP9Q5VTM2 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
AGAP9Q5VTM2 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
AGAP9Q5VTM2 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
AGAP9Q5VTM2 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
AGAP9Q5VTM2 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
AGAP9Q5VTM2 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
AGAP9Q5VTM2 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
AGAP9Q5VTM2 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
AGAP9Q5VTM2 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
AGAP9Q5VTM2 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
AGAP9Q5VTM2 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
AGAP9Q5VTM2 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
AGAP9Q5VTM2 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
AGAP9Q5VTM2 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
AGAP9Q5VTM2 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
AGAP9Q5VTM2 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
AGAP9Q5VTM2 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
AGAP9Q5VTM2 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms