Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT28

FAM27B, Protein FAM27A/B/C, humanhuman

Predictions only

Length 67 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27BQ5VT28 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FAM27BQ5VT28 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FAM27BQ5VT28 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FAM27BQ5VT28 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FAM27BQ5VT28 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FAM27BQ5VT28 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FAM27BQ5VT28 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FAM27BQ5VT28 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
FAM27BQ5VT28 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FAM27BQ5VT28 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FAM27BQ5VT28 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FAM27BQ5VT28 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FAM27BQ5VT28 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FAM27BQ5VT28 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FAM27BQ5VT28 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FAM27BQ5VT28 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM27BQ5VT28 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM27BQ5VT28 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FAM27BQ5VT28 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FAM27BQ5VT28 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FAM27BQ5VT28 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FAM27BQ5VT28 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FAM27BQ5VT28 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FAM27BQ5VT28 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FAM27BQ5VT28 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FAM27BQ5VT28 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FAM27BQ5VT28 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM27BQ5VT28 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM27BQ5VT28 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FAM27BQ5VT28 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FAM27BQ5VT28 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM27BQ5VT28 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM27BQ5VT28 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM27BQ5VT28 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM27BQ5VT28 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM27BQ5VT28 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM27BQ5VT28 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FAM27BQ5VT28 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FAM27BQ5VT28 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
FAM27BQ5VT28 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FAM27BQ5VT28 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FAM27BQ5VT28 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FAM27BQ5VT28 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FAM27BQ5VT28 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FAM27BQ5VT28 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FAM27BQ5VT28 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FAM27BQ5VT28 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FAM27BQ5VT28 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FAM27BQ5VT28 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FAM27BQ5VT28 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM27BQ5VT28 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM27BQ5VT28 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FAM27BQ5VT28 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FAM27BQ5VT28 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FAM27BQ5VT28 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
FAM27BQ5VT28 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FAM27BQ5VT28 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FAM27BQ5VT28 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM27BQ5VT28 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FAM27BQ5VT28 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FAM27BQ5VT28 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FAM27BQ5VT28 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FAM27BQ5VT28 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FAM27BQ5VT28 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FAM27BQ5VT28 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FAM27BQ5VT28 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM27BQ5VT28 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FAM27BQ5VT28 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM27BQ5VT28 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM27BQ5VT28 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FAM27BQ5VT28 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FAM27BQ5VT28 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FAM27BQ5VT28 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FAM27BQ5VT28 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FAM27BQ5VT28 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FAM27BQ5VT28 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FAM27BQ5VT28 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FAM27BQ5VT28 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
FAM27BQ5VT28 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FAM27BQ5VT28 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FAM27BQ5VT28 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FAM27BQ5VT28 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FAM27BQ5VT28 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FAM27BQ5VT28 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FAM27BQ5VT28 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FAM27BQ5VT28 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FAM27BQ5VT28 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FAM27BQ5VT28 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FAM27BQ5VT28 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FAM27BQ5VT28 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FAM27BQ5VT28 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
FAM27BQ5VT28 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FAM27BQ5VT28 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FAM27BQ5VT28 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FAM27BQ5VT28 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
FAM27BQ5VT28 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FAM27BQ5VT28 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FAM27BQ5VT28 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
FAM27BQ5VT28 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FAM27BQ5VT28 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms