Protein–RNA interactions for Protein: Q5TD94

RSPH4A, Radial spoke head protein 4 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 716 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPH4AQ5TD94 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.73■■■■■ 4.43
RSPH4AQ5TD94 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.68■■■■■ 4.42
RSPH4AQ5TD94 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC42.63■■■■■ 4.41
RSPH4AQ5TD94 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.63■■■■■ 4.41
RSPH4AQ5TD94 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC42.61■■■■■ 4.41
RSPH4AQ5TD94 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.59■■■■■ 4.41
RSPH4AQ5TD94 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC42.58■■■■■ 4.41
RSPH4AQ5TD94 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC42.55■■■■■ 4.4
RSPH4AQ5TD94 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC42.55■■■■■ 4.4
RSPH4AQ5TD94 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC42.54■■■■■ 4.4
RSPH4AQ5TD94 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC42.51■■■■■ 4.4
RSPH4AQ5TD94 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.49■■■■■ 4.39
RSPH4AQ5TD94 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.49■■■■■ 4.39
RSPH4AQ5TD94 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.48■■■■■ 4.39
RSPH4AQ5TD94 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC42.48■■■■■ 4.39
RSPH4AQ5TD94 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.48■■■■■ 4.39
RSPH4AQ5TD94 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC42.46■■■■■ 4.39
RSPH4AQ5TD94 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.46■■■■■ 4.39
RSPH4AQ5TD94 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.45■■■■■ 4.39
RSPH4AQ5TD94 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC42.44■■■■■ 4.38
RSPH4AQ5TD94 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.42■■■■■ 4.38
RSPH4AQ5TD94 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.42■■■■■ 4.38
RSPH4AQ5TD94 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC42.4■■■■■ 4.38
RSPH4AQ5TD94 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC42.39■■■■■ 4.38
RSPH4AQ5TD94 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.39■■■■■ 4.38
RSPH4AQ5TD94 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC42.39■■■■■ 4.38
RSPH4AQ5TD94 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC42.39■■■■■ 4.38
RSPH4AQ5TD94 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.37■■■■■ 4.37
RSPH4AQ5TD94 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC42.37■■■■■ 4.37
RSPH4AQ5TD94 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.36■■■■■ 4.37
RSPH4AQ5TD94 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC42.35■■■■■ 4.37
RSPH4AQ5TD94 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC42.34■■■■■ 4.37
RSPH4AQ5TD94 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC42.32■■■■■ 4.37
RSPH4AQ5TD94 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.29■■■■■ 4.36
RSPH4AQ5TD94 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.29■■■■■ 4.36
RSPH4AQ5TD94 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC42.29■■■■■ 4.36
RSPH4AQ5TD94 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.28■■■■■ 4.36
RSPH4AQ5TD94 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC42.28■■■■■ 4.36
RSPH4AQ5TD94 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC42.26■■■■■ 4.36
RSPH4AQ5TD94 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.25■■■■■ 4.35
RSPH4AQ5TD94 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC42.23■■■■■ 4.35
RSPH4AQ5TD94 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC42.21■■■■■ 4.35
RSPH4AQ5TD94 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC42.2■■■■■ 4.35
RSPH4AQ5TD94 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC42.19■■■■■ 4.34
RSPH4AQ5TD94 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.18■■■■■ 4.34
RSPH4AQ5TD94 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.17■■■■■ 4.34
RSPH4AQ5TD94 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC42.15■■■■■ 4.34
RSPH4AQ5TD94 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC42.14■■■■■ 4.34
RSPH4AQ5TD94 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.14■■■■■ 4.34
RSPH4AQ5TD94 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC42.13■■■■■ 4.34
RSPH4AQ5TD94 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC42.12■■■■■ 4.33
RSPH4AQ5TD94 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC42.1■■■■■ 4.33
RSPH4AQ5TD94 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.1■■■■■ 4.33
RSPH4AQ5TD94 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC42.09■■■■■ 4.33
RSPH4AQ5TD94 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.08■■■■■ 4.33
RSPH4AQ5TD94 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.07■■■■■ 4.33
RSPH4AQ5TD94 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC42.07■■■■■ 4.33
RSPH4AQ5TD94 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.06■■■■■ 4.32
RSPH4AQ5TD94 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC42.06■■■■■ 4.32
RSPH4AQ5TD94 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.06■■■■■ 4.32
RSPH4AQ5TD94 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC42.05■■■■■ 4.32
RSPH4AQ5TD94 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC42.05■■■■■ 4.32
RSPH4AQ5TD94 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC42.02■■■■■ 4.32
RSPH4AQ5TD94 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC42.02■■■■■ 4.32
RSPH4AQ5TD94 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.02■■■■■ 4.32
RSPH4AQ5TD94 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC42.01■■■■■ 4.32
RSPH4AQ5TD94 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.99■■■■■ 4.31
RSPH4AQ5TD94 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC41.98■■■■■ 4.31
RSPH4AQ5TD94 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.96■■■■■ 4.31
RSPH4AQ5TD94 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC41.93■■■■■ 4.3
RSPH4AQ5TD94 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC41.9■■■■■ 4.3
RSPH4AQ5TD94 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC41.87■■■■■ 4.29
RSPH4AQ5TD94 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC41.86■■■■■ 4.29
RSPH4AQ5TD94 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC41.86■■■■■ 4.29
RSPH4AQ5TD94 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC41.85■■■■■ 4.29
RSPH4AQ5TD94 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC41.83■■■■■ 4.29
RSPH4AQ5TD94 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC41.82■■■■■ 4.29
RSPH4AQ5TD94 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC41.82■■■■■ 4.29
RSPH4AQ5TD94 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC41.81■■■■■ 4.28
RSPH4AQ5TD94 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC41.81■■■■■ 4.28
RSPH4AQ5TD94 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC41.81■■■■■ 4.28
RSPH4AQ5TD94 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC41.8■■■■■ 4.28
RSPH4AQ5TD94 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC41.8■■■■■ 4.28
RSPH4AQ5TD94 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.79■■■■■ 4.28
RSPH4AQ5TD94 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC41.79■■■■■ 4.28
RSPH4AQ5TD94 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.78■■■■■ 4.28
RSPH4AQ5TD94 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.78■■■■■ 4.28
RSPH4AQ5TD94 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC41.77■■■■■ 4.28
RSPH4AQ5TD94 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC41.76■■■■■ 4.28
RSPH4AQ5TD94 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC41.75■■■■■ 4.27
RSPH4AQ5TD94 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.75■■■■■ 4.27
RSPH4AQ5TD94 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.73■■■■■ 4.27
RSPH4AQ5TD94 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.71■■■■■ 4.27
RSPH4AQ5TD94 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.7■■■■■ 4.27
RSPH4AQ5TD94 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.69■■■■■ 4.26
RSPH4AQ5TD94 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.68■■■■■ 4.26
RSPH4AQ5TD94 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC41.66■■■■■ 4.26
RSPH4AQ5TD94 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC41.65■■■■■ 4.26
RSPH4AQ5TD94 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC41.57■■■■■ 4.25
RSPH4AQ5TD94 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC41.55■■■■■ 4.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms