Protein–RNA interactions for Protein: Q5TB30

DEPDC1, DEP domain-containing protein 1A, humanhuman

Predictions only

Length 811 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEPDC1Q5TB30 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
DEPDC1Q5TB30 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
DEPDC1Q5TB30 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
DEPDC1Q5TB30 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
DEPDC1Q5TB30 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
DEPDC1Q5TB30 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
DEPDC1Q5TB30 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
DEPDC1Q5TB30 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
DEPDC1Q5TB30 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
DEPDC1Q5TB30 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
DEPDC1Q5TB30 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
DEPDC1Q5TB30 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
DEPDC1Q5TB30 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
DEPDC1Q5TB30 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
DEPDC1Q5TB30 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
DEPDC1Q5TB30 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
DEPDC1Q5TB30 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
DEPDC1Q5TB30 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
DEPDC1Q5TB30 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
DEPDC1Q5TB30 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
DEPDC1Q5TB30 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
DEPDC1Q5TB30 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
DEPDC1Q5TB30 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
DEPDC1Q5TB30 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
DEPDC1Q5TB30 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
DEPDC1Q5TB30 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
DEPDC1Q5TB30 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
DEPDC1Q5TB30 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
DEPDC1Q5TB30 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
DEPDC1Q5TB30 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
DEPDC1Q5TB30 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
DEPDC1Q5TB30 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
DEPDC1Q5TB30 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
DEPDC1Q5TB30 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
DEPDC1Q5TB30 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
DEPDC1Q5TB30 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
DEPDC1Q5TB30 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
DEPDC1Q5TB30 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
DEPDC1Q5TB30 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
DEPDC1Q5TB30 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
DEPDC1Q5TB30 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
DEPDC1Q5TB30 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
DEPDC1Q5TB30 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
DEPDC1Q5TB30 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
DEPDC1Q5TB30 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
DEPDC1Q5TB30 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
DEPDC1Q5TB30 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
DEPDC1Q5TB30 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.81
DEPDC1Q5TB30 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
DEPDC1Q5TB30 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
DEPDC1Q5TB30 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
DEPDC1Q5TB30 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
DEPDC1Q5TB30 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
DEPDC1Q5TB30 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
DEPDC1Q5TB30 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
DEPDC1Q5TB30 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
DEPDC1Q5TB30 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
DEPDC1Q5TB30 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
DEPDC1Q5TB30 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
DEPDC1Q5TB30 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
DEPDC1Q5TB30 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
DEPDC1Q5TB30 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
DEPDC1Q5TB30 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
DEPDC1Q5TB30 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
DEPDC1Q5TB30 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
DEPDC1Q5TB30 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
DEPDC1Q5TB30 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
DEPDC1Q5TB30 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
DEPDC1Q5TB30 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
DEPDC1Q5TB30 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
DEPDC1Q5TB30 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
DEPDC1Q5TB30 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
DEPDC1Q5TB30 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
DEPDC1Q5TB30 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
DEPDC1Q5TB30 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
DEPDC1Q5TB30 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
DEPDC1Q5TB30 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
DEPDC1Q5TB30 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
DEPDC1Q5TB30 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
DEPDC1Q5TB30 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
DEPDC1Q5TB30 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
DEPDC1Q5TB30 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
DEPDC1Q5TB30 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
DEPDC1Q5TB30 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
DEPDC1Q5TB30 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
DEPDC1Q5TB30 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
DEPDC1Q5TB30 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
DEPDC1Q5TB30 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
DEPDC1Q5TB30 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
DEPDC1Q5TB30 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
DEPDC1Q5TB30 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
DEPDC1Q5TB30 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
DEPDC1Q5TB30 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
DEPDC1Q5TB30 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
DEPDC1Q5TB30 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
DEPDC1Q5TB30 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
DEPDC1Q5TB30 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
DEPDC1Q5TB30 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
DEPDC1Q5TB30 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
DEPDC1Q5TB30 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms