Protein–RNA interactions for Protein: Q16649

NFIL3, Nuclear factor interleukin-3-regulated protein, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIL3Q16649 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC30.47■■■□□ 2.47
NFIL3Q16649 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
NFIL3Q16649 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
NFIL3Q16649 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
NFIL3Q16649 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
NFIL3Q16649 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
NFIL3Q16649 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC30.4■■■□□ 2.46
NFIL3Q16649 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
NFIL3Q16649 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.46
NFIL3Q16649 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC30.39■■■□□ 2.46
NFIL3Q16649 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
NFIL3Q16649 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
NFIL3Q16649 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
NFIL3Q16649 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
NFIL3Q16649 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
NFIL3Q16649 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
NFIL3Q16649 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
NFIL3Q16649 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
NFIL3Q16649 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
NFIL3Q16649 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
NFIL3Q16649 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
NFIL3Q16649 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
NFIL3Q16649 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
NFIL3Q16649 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
NFIL3Q16649 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
NFIL3Q16649 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
NFIL3Q16649 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
NFIL3Q16649 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
NFIL3Q16649 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
NFIL3Q16649 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
NFIL3Q16649 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
NFIL3Q16649 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
NFIL3Q16649 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
NFIL3Q16649 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC30.21■■■□□ 2.43
NFIL3Q16649 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
NFIL3Q16649 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
NFIL3Q16649 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
NFIL3Q16649 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
NFIL3Q16649 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
NFIL3Q16649 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
NFIL3Q16649 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
NFIL3Q16649 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
NFIL3Q16649 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC30.19■■■□□ 2.42
NFIL3Q16649 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
NFIL3Q16649 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
NFIL3Q16649 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
NFIL3Q16649 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
NFIL3Q16649 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
NFIL3Q16649 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
NFIL3Q16649 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
NFIL3Q16649 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
NFIL3Q16649 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
NFIL3Q16649 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
NFIL3Q16649 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
NFIL3Q16649 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
NFIL3Q16649 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
NFIL3Q16649 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
NFIL3Q16649 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
NFIL3Q16649 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
NFIL3Q16649 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
NFIL3Q16649 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
NFIL3Q16649 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
NFIL3Q16649 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
NFIL3Q16649 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
NFIL3Q16649 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
NFIL3Q16649 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
NFIL3Q16649 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
NFIL3Q16649 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC30.03■■■□□ 2.4
NFIL3Q16649 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
NFIL3Q16649 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
NFIL3Q16649 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
NFIL3Q16649 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
NFIL3Q16649 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
NFIL3Q16649 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
NFIL3Q16649 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
NFIL3Q16649 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
NFIL3Q16649 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
NFIL3Q16649 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
NFIL3Q16649 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
NFIL3Q16649 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
NFIL3Q16649 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
NFIL3Q16649 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
NFIL3Q16649 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
NFIL3Q16649 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
NFIL3Q16649 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
NFIL3Q16649 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
NFIL3Q16649 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
NFIL3Q16649 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
NFIL3Q16649 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
NFIL3Q16649 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
NFIL3Q16649 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
NFIL3Q16649 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
NFIL3Q16649 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
NFIL3Q16649 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
NFIL3Q16649 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
NFIL3Q16649 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
NFIL3Q16649 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
NFIL3Q16649 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
NFIL3Q16649 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
NFIL3Q16649 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms