Protein–RNA interactions for Protein: Q15828

CST6, Cystatin-M, humanhuman

Predictions only

Length 149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CST6Q15828 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CST6Q15828 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CST6Q15828 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CST6Q15828 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CST6Q15828 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CST6Q15828 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CST6Q15828 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CST6Q15828 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CST6Q15828 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CST6Q15828 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CST6Q15828 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CST6Q15828 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CST6Q15828 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CST6Q15828 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CST6Q15828 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
CST6Q15828 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CST6Q15828 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CST6Q15828 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CST6Q15828 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
CST6Q15828 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CST6Q15828 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CST6Q15828 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CST6Q15828 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CST6Q15828 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CST6Q15828 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CST6Q15828 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CST6Q15828 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
CST6Q15828 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CST6Q15828 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CST6Q15828 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CST6Q15828 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CST6Q15828 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CST6Q15828 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CST6Q15828 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CST6Q15828 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CST6Q15828 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CST6Q15828 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CST6Q15828 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CST6Q15828 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CST6Q15828 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CST6Q15828 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CST6Q15828 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
CST6Q15828 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CST6Q15828 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CST6Q15828 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CST6Q15828 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CST6Q15828 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CST6Q15828 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CST6Q15828 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CST6Q15828 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CST6Q15828 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CST6Q15828 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CST6Q15828 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CST6Q15828 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
CST6Q15828 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
CST6Q15828 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CST6Q15828 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
CST6Q15828 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CST6Q15828 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CST6Q15828 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CST6Q15828 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CST6Q15828 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CST6Q15828 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CST6Q15828 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CST6Q15828 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CST6Q15828 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CST6Q15828 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CST6Q15828 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CST6Q15828 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CST6Q15828 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CST6Q15828 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CST6Q15828 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CST6Q15828 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CST6Q15828 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CST6Q15828 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CST6Q15828 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CST6Q15828 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CST6Q15828 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CST6Q15828 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
CST6Q15828 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CST6Q15828 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CST6Q15828 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CST6Q15828 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CST6Q15828 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CST6Q15828 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.56■■■□□ 2
CST6Q15828 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CST6Q15828 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CST6Q15828 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CST6Q15828 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CST6Q15828 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
CST6Q15828 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CST6Q15828 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
CST6Q15828 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
CST6Q15828 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CST6Q15828 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CST6Q15828 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CST6Q15828 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CST6Q15828 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CST6Q15828 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CST6Q15828 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms