Protein–RNA interactions for Protein: Q15828

CST6, Cystatin-M, humanhuman

Predictions only

Length 149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CST6Q15828 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC34.78■■■■□ 3.16
CST6Q15828 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC33.94■■■■□ 3.02
CST6Q15828 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
CST6Q15828 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
CST6Q15828 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
CST6Q15828 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
CST6Q15828 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
CST6Q15828 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.37■■■□□ 2.93
CST6Q15828 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
CST6Q15828 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
CST6Q15828 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
CST6Q15828 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
CST6Q15828 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
CST6Q15828 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC32.39■■■□□ 2.78
CST6Q15828 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC32.38■■■□□ 2.77
CST6Q15828 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
CST6Q15828 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
CST6Q15828 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
CST6Q15828 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
CST6Q15828 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
CST6Q15828 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
CST6Q15828 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
CST6Q15828 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
CST6Q15828 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
CST6Q15828 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
CST6Q15828 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
CST6Q15828 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
CST6Q15828 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC31.44■■■□□ 2.62
CST6Q15828 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
CST6Q15828 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
CST6Q15828 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
CST6Q15828 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
CST6Q15828 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
CST6Q15828 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
CST6Q15828 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
CST6Q15828 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
CST6Q15828 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CST6Q15828 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
CST6Q15828 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
CST6Q15828 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC30.79■■■□□ 2.52
CST6Q15828 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
CST6Q15828 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
CST6Q15828 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
CST6Q15828 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
CST6Q15828 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
CST6Q15828 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
CST6Q15828 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CST6Q15828 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
CST6Q15828 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
CST6Q15828 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CST6Q15828 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
CST6Q15828 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
CST6Q15828 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
CST6Q15828 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
CST6Q15828 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
CST6Q15828 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
CST6Q15828 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CST6Q15828 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
CST6Q15828 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
CST6Q15828 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CST6Q15828 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CST6Q15828 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CST6Q15828 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CST6Q15828 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CST6Q15828 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CST6Q15828 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
CST6Q15828 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CST6Q15828 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CST6Q15828 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CST6Q15828 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CST6Q15828 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CST6Q15828 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CST6Q15828 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CST6Q15828 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CST6Q15828 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CST6Q15828 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
CST6Q15828 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CST6Q15828 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CST6Q15828 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CST6Q15828 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CST6Q15828 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CST6Q15828 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CST6Q15828 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CST6Q15828 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CST6Q15828 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CST6Q15828 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CST6Q15828 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CST6Q15828 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CST6Q15828 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CST6Q15828 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CST6Q15828 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CST6Q15828 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
CST6Q15828 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CST6Q15828 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CST6Q15828 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CST6Q15828 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CST6Q15828 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CST6Q15828 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CST6Q15828 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CST6Q15828 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms