Protein–RNA interactions for Protein: Q15546

MMD, Monocyte to macrophage differentiation factor, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMDQ15546 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MMDQ15546 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MMDQ15546 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MMDQ15546 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MMDQ15546 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MMDQ15546 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MMDQ15546 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MMDQ15546 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MMDQ15546 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MMDQ15546 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MMDQ15546 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MMDQ15546 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MMDQ15546 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MMDQ15546 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MMDQ15546 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MMDQ15546 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MMDQ15546 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MMDQ15546 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MMDQ15546 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MMDQ15546 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MMDQ15546 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MMDQ15546 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MMDQ15546 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MMDQ15546 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MMDQ15546 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MMDQ15546 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MMDQ15546 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MMDQ15546 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MMDQ15546 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MMDQ15546 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MMDQ15546 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MMDQ15546 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MMDQ15546 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MMDQ15546 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MMDQ15546 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MMDQ15546 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MMDQ15546 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MMDQ15546 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MMDQ15546 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MMDQ15546 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MMDQ15546 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MMDQ15546 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MMDQ15546 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MMDQ15546 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MMDQ15546 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MMDQ15546 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MMDQ15546 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MMDQ15546 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MMDQ15546 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MMDQ15546 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MMDQ15546 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MMDQ15546 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MMDQ15546 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MMDQ15546 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MMDQ15546 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MMDQ15546 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MMDQ15546 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MMDQ15546 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MMDQ15546 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MMDQ15546 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MMDQ15546 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MMDQ15546 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MMDQ15546 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MMDQ15546 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MMDQ15546 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MMDQ15546 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MMDQ15546 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MMDQ15546 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MMDQ15546 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MMDQ15546 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MMDQ15546 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MMDQ15546 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MMDQ15546 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MMDQ15546 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MMDQ15546 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MMDQ15546 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MMDQ15546 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MMDQ15546 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MMDQ15546 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MMDQ15546 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MMDQ15546 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
MMDQ15546 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
MMDQ15546 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MMDQ15546 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MMDQ15546 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
MMDQ15546 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MMDQ15546 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MMDQ15546 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MMDQ15546 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MMDQ15546 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MMDQ15546 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MMDQ15546 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MMDQ15546 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MMDQ15546 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MMDQ15546 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MMDQ15546 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MMDQ15546 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
MMDQ15546 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MMDQ15546 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MMDQ15546 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms