Protein–RNA interactions for Protein: Q15027

ACAP1, Arf-GAP with coiled-coil, ANK repeat and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAP1Q15027 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ACAP1Q15027 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ACAP1Q15027 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ACAP1Q15027 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
ACAP1Q15027 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ACAP1Q15027 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ACAP1Q15027 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ACAP1Q15027 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ACAP1Q15027 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ACAP1Q15027 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ACAP1Q15027 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ACAP1Q15027 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ACAP1Q15027 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ACAP1Q15027 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ACAP1Q15027 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ACAP1Q15027 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ACAP1Q15027 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ACAP1Q15027 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ACAP1Q15027 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ACAP1Q15027 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ACAP1Q15027 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ACAP1Q15027 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ACAP1Q15027 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ACAP1Q15027 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ACAP1Q15027 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ACAP1Q15027 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ACAP1Q15027 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ACAP1Q15027 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ACAP1Q15027 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ACAP1Q15027 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ACAP1Q15027 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ACAP1Q15027 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ACAP1Q15027 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ACAP1Q15027 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ACAP1Q15027 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ACAP1Q15027 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ACAP1Q15027 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ACAP1Q15027 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ACAP1Q15027 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ACAP1Q15027 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ACAP1Q15027 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ACAP1Q15027 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ACAP1Q15027 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ACAP1Q15027 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ACAP1Q15027 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
ACAP1Q15027 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ACAP1Q15027 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ACAP1Q15027 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ACAP1Q15027 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ACAP1Q15027 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ACAP1Q15027 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ACAP1Q15027 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ACAP1Q15027 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ACAP1Q15027 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ACAP1Q15027 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ACAP1Q15027 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ACAP1Q15027 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ACAP1Q15027 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ACAP1Q15027 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ACAP1Q15027 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ACAP1Q15027 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ACAP1Q15027 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ACAP1Q15027 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ACAP1Q15027 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ACAP1Q15027 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ACAP1Q15027 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ACAP1Q15027 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
ACAP1Q15027 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
ACAP1Q15027 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
ACAP1Q15027 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
ACAP1Q15027 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
ACAP1Q15027 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
ACAP1Q15027 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ACAP1Q15027 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ACAP1Q15027 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ACAP1Q15027 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ACAP1Q15027 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ACAP1Q15027 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ACAP1Q15027 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ACAP1Q15027 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ACAP1Q15027 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ACAP1Q15027 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ACAP1Q15027 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ACAP1Q15027 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ACAP1Q15027 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ACAP1Q15027 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ACAP1Q15027 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ACAP1Q15027 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ACAP1Q15027 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ACAP1Q15027 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ACAP1Q15027 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ACAP1Q15027 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ACAP1Q15027 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ACAP1Q15027 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ACAP1Q15027 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ACAP1Q15027 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ACAP1Q15027 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ACAP1Q15027 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ACAP1Q15027 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ACAP1Q15027 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms