Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GBX1Q14549 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
GBX1Q14549 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GBX1Q14549 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GBX1Q14549 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GBX1Q14549 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GBX1Q14549 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
GBX1Q14549 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GBX1Q14549 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GBX1Q14549 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GBX1Q14549 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GBX1Q14549 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GBX1Q14549 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GBX1Q14549 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
GBX1Q14549 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
GBX1Q14549 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
GBX1Q14549 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
GBX1Q14549 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
GBX1Q14549 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
GBX1Q14549 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
GBX1Q14549 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
GBX1Q14549 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
GBX1Q14549 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
GBX1Q14549 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GBX1Q14549 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GBX1Q14549 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GBX1Q14549 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GBX1Q14549 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
GBX1Q14549 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
GBX1Q14549 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
GBX1Q14549 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GBX1Q14549 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GBX1Q14549 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GBX1Q14549 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GBX1Q14549 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GBX1Q14549 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GBX1Q14549 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GBX1Q14549 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GBX1Q14549 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GBX1Q14549 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GBX1Q14549 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GBX1Q14549 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GBX1Q14549 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GBX1Q14549 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GBX1Q14549 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GBX1Q14549 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GBX1Q14549 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GBX1Q14549 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GBX1Q14549 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GBX1Q14549 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
GBX1Q14549 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GBX1Q14549 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GBX1Q14549 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GBX1Q14549 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
GBX1Q14549 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
GBX1Q14549 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GBX1Q14549 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GBX1Q14549 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GBX1Q14549 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GBX1Q14549 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GBX1Q14549 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
GBX1Q14549 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
GBX1Q14549 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
GBX1Q14549 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GBX1Q14549 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
GBX1Q14549 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GBX1Q14549 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GBX1Q14549 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GBX1Q14549 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
GBX1Q14549 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
GBX1Q14549 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
GBX1Q14549 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GBX1Q14549 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GBX1Q14549 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GBX1Q14549 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GBX1Q14549 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GBX1Q14549 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GBX1Q14549 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GBX1Q14549 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GBX1Q14549 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GBX1Q14549 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GBX1Q14549 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GBX1Q14549 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GBX1Q14549 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GBX1Q14549 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GBX1Q14549 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GBX1Q14549 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
GBX1Q14549 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GBX1Q14549 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GBX1Q14549 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GBX1Q14549 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GBX1Q14549 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GBX1Q14549 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
GBX1Q14549 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GBX1Q14549 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GBX1Q14549 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GBX1Q14549 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GBX1Q14549 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GBX1Q14549 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
GBX1Q14549 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
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