Protein–RNA interactions for Protein: Q14139

UBE4A, Ubiquitin conjugation factor E4 A, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE4AQ14139 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
UBE4AQ14139 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
UBE4AQ14139 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
UBE4AQ14139 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
UBE4AQ14139 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
UBE4AQ14139 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
UBE4AQ14139 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
UBE4AQ14139 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
UBE4AQ14139 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
UBE4AQ14139 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
UBE4AQ14139 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
UBE4AQ14139 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC34.33■■■■□ 3.09
UBE4AQ14139 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC34.32■■■■□ 3.08
UBE4AQ14139 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
UBE4AQ14139 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
UBE4AQ14139 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
UBE4AQ14139 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
UBE4AQ14139 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.28■■■■□ 3.08
UBE4AQ14139 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
UBE4AQ14139 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
UBE4AQ14139 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
UBE4AQ14139 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
UBE4AQ14139 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
UBE4AQ14139 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
UBE4AQ14139 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
UBE4AQ14139 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
UBE4AQ14139 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
UBE4AQ14139 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC34.13■■■■□ 3.05
UBE4AQ14139 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
UBE4AQ14139 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
UBE4AQ14139 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC34.11■■■■□ 3.05
UBE4AQ14139 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
UBE4AQ14139 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
UBE4AQ14139 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
UBE4AQ14139 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
UBE4AQ14139 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
UBE4AQ14139 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
UBE4AQ14139 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
UBE4AQ14139 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
UBE4AQ14139 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
UBE4AQ14139 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
UBE4AQ14139 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
UBE4AQ14139 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
UBE4AQ14139 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC33.95■■■■□ 3.03
UBE4AQ14139 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
UBE4AQ14139 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
UBE4AQ14139 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
UBE4AQ14139 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
UBE4AQ14139 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
UBE4AQ14139 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
UBE4AQ14139 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
UBE4AQ14139 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC33.85■■■■□ 3.01
UBE4AQ14139 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
UBE4AQ14139 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
UBE4AQ14139 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC33.83■■■■□ 3.01
UBE4AQ14139 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
UBE4AQ14139 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
UBE4AQ14139 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC33.82■■■■□ 3
UBE4AQ14139 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
UBE4AQ14139 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
UBE4AQ14139 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
UBE4AQ14139 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
UBE4AQ14139 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
UBE4AQ14139 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
UBE4AQ14139 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
UBE4AQ14139 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC33.76■■■□□ 2.99
UBE4AQ14139 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
UBE4AQ14139 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
UBE4AQ14139 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC33.73■■■□□ 2.99
UBE4AQ14139 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
UBE4AQ14139 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
UBE4AQ14139 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
UBE4AQ14139 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
UBE4AQ14139 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
UBE4AQ14139 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
UBE4AQ14139 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
UBE4AQ14139 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
UBE4AQ14139 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
UBE4AQ14139 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
UBE4AQ14139 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
UBE4AQ14139 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
UBE4AQ14139 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
UBE4AQ14139 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
UBE4AQ14139 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC33.64■■■□□ 2.98
UBE4AQ14139 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
UBE4AQ14139 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
UBE4AQ14139 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
UBE4AQ14139 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
UBE4AQ14139 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
UBE4AQ14139 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
UBE4AQ14139 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
UBE4AQ14139 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
UBE4AQ14139 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
UBE4AQ14139 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
UBE4AQ14139 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
UBE4AQ14139 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
UBE4AQ14139 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
UBE4AQ14139 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC33.53■■■□□ 2.96
UBE4AQ14139 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
UBE4AQ14139 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
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