Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SEMA3BQ13214 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SEMA3BQ13214 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SEMA3BQ13214 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SEMA3BQ13214 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SEMA3BQ13214 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SEMA3BQ13214 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SEMA3BQ13214 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SEMA3BQ13214 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SEMA3BQ13214 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SEMA3BQ13214 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SEMA3BQ13214 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SEMA3BQ13214 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SEMA3BQ13214 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SEMA3BQ13214 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SEMA3BQ13214 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SEMA3BQ13214 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SEMA3BQ13214 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SEMA3BQ13214 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SEMA3BQ13214 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
SEMA3BQ13214 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SEMA3BQ13214 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SEMA3BQ13214 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SEMA3BQ13214 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SEMA3BQ13214 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SEMA3BQ13214 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SEMA3BQ13214 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SEMA3BQ13214 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SEMA3BQ13214 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SEMA3BQ13214 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SEMA3BQ13214 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SEMA3BQ13214 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SEMA3BQ13214 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SEMA3BQ13214 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SEMA3BQ13214 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SEMA3BQ13214 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SEMA3BQ13214 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SEMA3BQ13214 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SEMA3BQ13214 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SEMA3BQ13214 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SEMA3BQ13214 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SEMA3BQ13214 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SEMA3BQ13214 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
SEMA3BQ13214 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
SEMA3BQ13214 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SEMA3BQ13214 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SEMA3BQ13214 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SEMA3BQ13214 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SEMA3BQ13214 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SEMA3BQ13214 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.16
SEMA3BQ13214 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SEMA3BQ13214 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SEMA3BQ13214 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SEMA3BQ13214 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SEMA3BQ13214 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SEMA3BQ13214 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
SEMA3BQ13214 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SEMA3BQ13214 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SEMA3BQ13214 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SEMA3BQ13214 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SEMA3BQ13214 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
SEMA3BQ13214 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SEMA3BQ13214 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SEMA3BQ13214 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
SEMA3BQ13214 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SEMA3BQ13214 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SEMA3BQ13214 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
SEMA3BQ13214 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SEMA3BQ13214 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SEMA3BQ13214 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
SEMA3BQ13214 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SEMA3BQ13214 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SEMA3BQ13214 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SEMA3BQ13214 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SEMA3BQ13214 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SEMA3BQ13214 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SEMA3BQ13214 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SEMA3BQ13214 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SEMA3BQ13214 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SEMA3BQ13214 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SEMA3BQ13214 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SEMA3BQ13214 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SEMA3BQ13214 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SEMA3BQ13214 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
SEMA3BQ13214 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SEMA3BQ13214 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SEMA3BQ13214 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SEMA3BQ13214 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SEMA3BQ13214 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SEMA3BQ13214 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SEMA3BQ13214 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SEMA3BQ13214 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SEMA3BQ13214 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SEMA3BQ13214 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SEMA3BQ13214 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SEMA3BQ13214 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SEMA3BQ13214 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SEMA3BQ13214 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SEMA3BQ13214 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
SEMA3BQ13214 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms