Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

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Length 749 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC35.31■■■■□ 3.24
SEMA3BQ13214 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
SEMA3BQ13214 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
SEMA3BQ13214 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
SEMA3BQ13214 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
SEMA3BQ13214 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
SEMA3BQ13214 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
SEMA3BQ13214 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC33.84■■■■□ 3.01
SEMA3BQ13214 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
SEMA3BQ13214 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
SEMA3BQ13214 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
SEMA3BQ13214 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.4■■■□□ 2.94
SEMA3BQ13214 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
SEMA3BQ13214 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
SEMA3BQ13214 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
SEMA3BQ13214 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
SEMA3BQ13214 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
SEMA3BQ13214 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
SEMA3BQ13214 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
SEMA3BQ13214 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC32.43■■■□□ 2.78
SEMA3BQ13214 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
SEMA3BQ13214 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC32.38■■■□□ 2.77
SEMA3BQ13214 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
SEMA3BQ13214 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
SEMA3BQ13214 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC32.23■■■□□ 2.75
SEMA3BQ13214 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
SEMA3BQ13214 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC32.14■■■□□ 2.74
SEMA3BQ13214 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
SEMA3BQ13214 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
SEMA3BQ13214 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
SEMA3BQ13214 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
SEMA3BQ13214 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
SEMA3BQ13214 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
SEMA3BQ13214 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
SEMA3BQ13214 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
SEMA3BQ13214 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
SEMA3BQ13214 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
SEMA3BQ13214 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
SEMA3BQ13214 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
SEMA3BQ13214 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
SEMA3BQ13214 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC31.53■■■□□ 2.64
SEMA3BQ13214 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
SEMA3BQ13214 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
SEMA3BQ13214 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
SEMA3BQ13214 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
SEMA3BQ13214 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
SEMA3BQ13214 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC31.28■■■□□ 2.6
SEMA3BQ13214 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
SEMA3BQ13214 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
SEMA3BQ13214 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
SEMA3BQ13214 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
SEMA3BQ13214 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
SEMA3BQ13214 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
SEMA3BQ13214 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
SEMA3BQ13214 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
SEMA3BQ13214 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
SEMA3BQ13214 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC30.95■■■□□ 2.55
SEMA3BQ13214 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
SEMA3BQ13214 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
SEMA3BQ13214 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
SEMA3BQ13214 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
SEMA3BQ13214 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
SEMA3BQ13214 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC30.78■■■□□ 2.52
SEMA3BQ13214 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
SEMA3BQ13214 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
SEMA3BQ13214 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
SEMA3BQ13214 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
SEMA3BQ13214 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
SEMA3BQ13214 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
SEMA3BQ13214 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
SEMA3BQ13214 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
SEMA3BQ13214 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
SEMA3BQ13214 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
SEMA3BQ13214 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
SEMA3BQ13214 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
SEMA3BQ13214 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
SEMA3BQ13214 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
SEMA3BQ13214 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
SEMA3BQ13214 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
SEMA3BQ13214 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
SEMA3BQ13214 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
SEMA3BQ13214 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
SEMA3BQ13214 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC30.4■■■□□ 2.46
SEMA3BQ13214 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
SEMA3BQ13214 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
SEMA3BQ13214 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
SEMA3BQ13214 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
SEMA3BQ13214 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
SEMA3BQ13214 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
SEMA3BQ13214 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
SEMA3BQ13214 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
SEMA3BQ13214 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
SEMA3BQ13214 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
SEMA3BQ13214 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
SEMA3BQ13214 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SEMA3BQ13214 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
SEMA3BQ13214 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
SEMA3BQ13214 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SEMA3BQ13214 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
SEMA3BQ13214 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
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