Protein–RNA interactions for Protein: Q08397

LOXL1, Lysyl oxidase homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL1Q08397 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LOXL1Q08397 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
LOXL1Q08397 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LOXL1Q08397 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LOXL1Q08397 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LOXL1Q08397 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LOXL1Q08397 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LOXL1Q08397 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LOXL1Q08397 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LOXL1Q08397 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LOXL1Q08397 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LOXL1Q08397 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LOXL1Q08397 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
LOXL1Q08397 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LOXL1Q08397 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LOXL1Q08397 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LOXL1Q08397 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LOXL1Q08397 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LOXL1Q08397 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LOXL1Q08397 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LOXL1Q08397 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LOXL1Q08397 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LOXL1Q08397 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LOXL1Q08397 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LOXL1Q08397 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LOXL1Q08397 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LOXL1Q08397 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LOXL1Q08397 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LOXL1Q08397 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LOXL1Q08397 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
LOXL1Q08397 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LOXL1Q08397 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LOXL1Q08397 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LOXL1Q08397 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LOXL1Q08397 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LOXL1Q08397 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LOXL1Q08397 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LOXL1Q08397 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LOXL1Q08397 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LOXL1Q08397 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LOXL1Q08397 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LOXL1Q08397 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LOXL1Q08397 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LOXL1Q08397 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LOXL1Q08397 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LOXL1Q08397 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LOXL1Q08397 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LOXL1Q08397 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LOXL1Q08397 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LOXL1Q08397 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LOXL1Q08397 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LOXL1Q08397 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LOXL1Q08397 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LOXL1Q08397 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LOXL1Q08397 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LOXL1Q08397 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LOXL1Q08397 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
LOXL1Q08397 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LOXL1Q08397 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LOXL1Q08397 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LOXL1Q08397 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
LOXL1Q08397 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LOXL1Q08397 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
LOXL1Q08397 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
LOXL1Q08397 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LOXL1Q08397 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LOXL1Q08397 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LOXL1Q08397 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LOXL1Q08397 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LOXL1Q08397 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LOXL1Q08397 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
LOXL1Q08397 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23■■□□□ 1.27
LOXL1Q08397 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23■■□□□ 1.27
LOXL1Q08397 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LOXL1Q08397 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LOXL1Q08397 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LOXL1Q08397 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LOXL1Q08397 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LOXL1Q08397 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LOXL1Q08397 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LOXL1Q08397 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LOXL1Q08397 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LOXL1Q08397 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LOXL1Q08397 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LOXL1Q08397 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LOXL1Q08397 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LOXL1Q08397 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LOXL1Q08397 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LOXL1Q08397 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LOXL1Q08397 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LOXL1Q08397 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LOXL1Q08397 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LOXL1Q08397 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LOXL1Q08397 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LOXL1Q08397 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LOXL1Q08397 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LOXL1Q08397 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LOXL1Q08397 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
LOXL1Q08397 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LOXL1Q08397 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms