Protein–RNA interactions for Protein: Q08380

LGALS3BP, Galectin-3-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGALS3BPQ08380 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LGALS3BPQ08380 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LGALS3BPQ08380 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LGALS3BPQ08380 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LGALS3BPQ08380 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LGALS3BPQ08380 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LGALS3BPQ08380 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
LGALS3BPQ08380 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LGALS3BPQ08380 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LGALS3BPQ08380 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LGALS3BPQ08380 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LGALS3BPQ08380 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LGALS3BPQ08380 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LGALS3BPQ08380 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
LGALS3BPQ08380 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LGALS3BPQ08380 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LGALS3BPQ08380 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LGALS3BPQ08380 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LGALS3BPQ08380 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LGALS3BPQ08380 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LGALS3BPQ08380 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LGALS3BPQ08380 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LGALS3BPQ08380 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LGALS3BPQ08380 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LGALS3BPQ08380 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LGALS3BPQ08380 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LGALS3BPQ08380 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LGALS3BPQ08380 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LGALS3BPQ08380 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LGALS3BPQ08380 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LGALS3BPQ08380 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LGALS3BPQ08380 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LGALS3BPQ08380 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
LGALS3BPQ08380 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LGALS3BPQ08380 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LGALS3BPQ08380 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LGALS3BPQ08380 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LGALS3BPQ08380 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LGALS3BPQ08380 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.59
LGALS3BPQ08380 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LGALS3BPQ08380 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LGALS3BPQ08380 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LGALS3BPQ08380 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LGALS3BPQ08380 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LGALS3BPQ08380 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LGALS3BPQ08380 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LGALS3BPQ08380 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LGALS3BPQ08380 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LGALS3BPQ08380 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LGALS3BPQ08380 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LGALS3BPQ08380 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
LGALS3BPQ08380 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LGALS3BPQ08380 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LGALS3BPQ08380 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LGALS3BPQ08380 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LGALS3BPQ08380 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LGALS3BPQ08380 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LGALS3BPQ08380 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LGALS3BPQ08380 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LGALS3BPQ08380 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LGALS3BPQ08380 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LGALS3BPQ08380 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
LGALS3BPQ08380 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LGALS3BPQ08380 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LGALS3BPQ08380 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LGALS3BPQ08380 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LGALS3BPQ08380 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LGALS3BPQ08380 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LGALS3BPQ08380 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LGALS3BPQ08380 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LGALS3BPQ08380 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LGALS3BPQ08380 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LGALS3BPQ08380 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LGALS3BPQ08380 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LGALS3BPQ08380 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LGALS3BPQ08380 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LGALS3BPQ08380 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LGALS3BPQ08380 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LGALS3BPQ08380 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LGALS3BPQ08380 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LGALS3BPQ08380 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LGALS3BPQ08380 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LGALS3BPQ08380 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LGALS3BPQ08380 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LGALS3BPQ08380 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LGALS3BPQ08380 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LGALS3BPQ08380 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LGALS3BPQ08380 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LGALS3BPQ08380 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LGALS3BPQ08380 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LGALS3BPQ08380 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
LGALS3BPQ08380 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LGALS3BPQ08380 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LGALS3BPQ08380 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LGALS3BPQ08380 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LGALS3BPQ08380 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LGALS3BPQ08380 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LGALS3BPQ08380 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LGALS3BPQ08380 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LGALS3BPQ08380 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms