Protein–RNA interactions for Protein: Q08188

TGM3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM3Q08188 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TGM3Q08188 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TGM3Q08188 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TGM3Q08188 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TGM3Q08188 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TGM3Q08188 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TGM3Q08188 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TGM3Q08188 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TGM3Q08188 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TGM3Q08188 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TGM3Q08188 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TGM3Q08188 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TGM3Q08188 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TGM3Q08188 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TGM3Q08188 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TGM3Q08188 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TGM3Q08188 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TGM3Q08188 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TGM3Q08188 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TGM3Q08188 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TGM3Q08188 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TGM3Q08188 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TGM3Q08188 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TGM3Q08188 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TGM3Q08188 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TGM3Q08188 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TGM3Q08188 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TGM3Q08188 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
TGM3Q08188 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TGM3Q08188 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TGM3Q08188 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TGM3Q08188 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TGM3Q08188 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TGM3Q08188 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TGM3Q08188 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TGM3Q08188 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TGM3Q08188 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TGM3Q08188 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TGM3Q08188 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TGM3Q08188 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TGM3Q08188 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TGM3Q08188 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TGM3Q08188 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TGM3Q08188 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TGM3Q08188 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TGM3Q08188 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TGM3Q08188 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TGM3Q08188 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TGM3Q08188 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
TGM3Q08188 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TGM3Q08188 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TGM3Q08188 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TGM3Q08188 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TGM3Q08188 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TGM3Q08188 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TGM3Q08188 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
TGM3Q08188 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TGM3Q08188 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TGM3Q08188 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TGM3Q08188 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TGM3Q08188 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TGM3Q08188 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TGM3Q08188 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TGM3Q08188 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TGM3Q08188 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TGM3Q08188 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TGM3Q08188 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TGM3Q08188 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TGM3Q08188 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TGM3Q08188 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TGM3Q08188 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TGM3Q08188 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TGM3Q08188 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TGM3Q08188 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TGM3Q08188 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TGM3Q08188 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TGM3Q08188 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TGM3Q08188 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TGM3Q08188 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TGM3Q08188 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TGM3Q08188 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TGM3Q08188 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TGM3Q08188 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
TGM3Q08188 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TGM3Q08188 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
TGM3Q08188 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TGM3Q08188 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TGM3Q08188 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TGM3Q08188 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TGM3Q08188 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TGM3Q08188 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TGM3Q08188 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TGM3Q08188 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TGM3Q08188 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TGM3Q08188 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TGM3Q08188 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TGM3Q08188 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TGM3Q08188 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TGM3Q08188 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TGM3Q08188 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms