Protein–RNA interactions for Protein: Q03692

COL10A1, Collagen alpha-1(X) chain, humanhuman

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL10A1Q03692 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
COL10A1Q03692 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
COL10A1Q03692 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
COL10A1Q03692 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
COL10A1Q03692 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
COL10A1Q03692 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COL10A1Q03692 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
COL10A1Q03692 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COL10A1Q03692 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
COL10A1Q03692 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
COL10A1Q03692 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COL10A1Q03692 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
COL10A1Q03692 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
COL10A1Q03692 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
COL10A1Q03692 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COL10A1Q03692 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
COL10A1Q03692 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COL10A1Q03692 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COL10A1Q03692 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COL10A1Q03692 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COL10A1Q03692 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
COL10A1Q03692 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
COL10A1Q03692 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
COL10A1Q03692 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
COL10A1Q03692 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
COL10A1Q03692 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
COL10A1Q03692 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
COL10A1Q03692 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
COL10A1Q03692 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
COL10A1Q03692 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
COL10A1Q03692 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
COL10A1Q03692 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
COL10A1Q03692 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
COL10A1Q03692 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
COL10A1Q03692 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
COL10A1Q03692 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
COL10A1Q03692 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
COL10A1Q03692 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
COL10A1Q03692 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
COL10A1Q03692 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
COL10A1Q03692 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
COL10A1Q03692 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
COL10A1Q03692 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
COL10A1Q03692 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
COL10A1Q03692 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
COL10A1Q03692 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
COL10A1Q03692 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
COL10A1Q03692 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
COL10A1Q03692 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
COL10A1Q03692 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
COL10A1Q03692 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
COL10A1Q03692 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
COL10A1Q03692 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
COL10A1Q03692 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
COL10A1Q03692 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
COL10A1Q03692 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
COL10A1Q03692 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
COL10A1Q03692 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
COL10A1Q03692 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
COL10A1Q03692 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
COL10A1Q03692 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
COL10A1Q03692 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
COL10A1Q03692 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
COL10A1Q03692 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
COL10A1Q03692 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
COL10A1Q03692 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
COL10A1Q03692 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
COL10A1Q03692 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
COL10A1Q03692 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
COL10A1Q03692 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
COL10A1Q03692 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
COL10A1Q03692 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
COL10A1Q03692 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COL10A1Q03692 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COL10A1Q03692 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
COL10A1Q03692 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
COL10A1Q03692 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
COL10A1Q03692 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
COL10A1Q03692 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
COL10A1Q03692 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
COL10A1Q03692 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COL10A1Q03692 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL10A1Q03692 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL10A1Q03692 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL10A1Q03692 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL10A1Q03692 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL10A1Q03692 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL10A1Q03692 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL10A1Q03692 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL10A1Q03692 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
COL10A1Q03692 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
COL10A1Q03692 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
COL10A1Q03692 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
COL10A1Q03692 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COL10A1Q03692 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COL10A1Q03692 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COL10A1Q03692 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COL10A1Q03692 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
COL10A1Q03692 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
COL10A1Q03692 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms