Protein–RNA interactions for Protein: Q02509

OC90, Otoconin-90, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OC90Q02509 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
OC90Q02509 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
OC90Q02509 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
OC90Q02509 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
OC90Q02509 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
OC90Q02509 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
OC90Q02509 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
OC90Q02509 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
OC90Q02509 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
OC90Q02509 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
OC90Q02509 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
OC90Q02509 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
OC90Q02509 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
OC90Q02509 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
OC90Q02509 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
OC90Q02509 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
OC90Q02509 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
OC90Q02509 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
OC90Q02509 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
OC90Q02509 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
OC90Q02509 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
OC90Q02509 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
OC90Q02509 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
OC90Q02509 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
OC90Q02509 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
OC90Q02509 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
OC90Q02509 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
OC90Q02509 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
OC90Q02509 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
OC90Q02509 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
OC90Q02509 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
OC90Q02509 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
OC90Q02509 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
OC90Q02509 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
OC90Q02509 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
OC90Q02509 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
OC90Q02509 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
OC90Q02509 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
OC90Q02509 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
OC90Q02509 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
OC90Q02509 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
OC90Q02509 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
OC90Q02509 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
OC90Q02509 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
OC90Q02509 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
OC90Q02509 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
OC90Q02509 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
OC90Q02509 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
OC90Q02509 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
OC90Q02509 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
OC90Q02509 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
OC90Q02509 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
OC90Q02509 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
OC90Q02509 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
OC90Q02509 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
OC90Q02509 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
OC90Q02509 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
OC90Q02509 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
OC90Q02509 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
OC90Q02509 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
OC90Q02509 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
OC90Q02509 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
OC90Q02509 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
OC90Q02509 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
OC90Q02509 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
OC90Q02509 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
OC90Q02509 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
OC90Q02509 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
OC90Q02509 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
OC90Q02509 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
OC90Q02509 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
OC90Q02509 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
OC90Q02509 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
OC90Q02509 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
OC90Q02509 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
OC90Q02509 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
OC90Q02509 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
OC90Q02509 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
OC90Q02509 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
OC90Q02509 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
OC90Q02509 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
OC90Q02509 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
OC90Q02509 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
OC90Q02509 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
OC90Q02509 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
OC90Q02509 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
OC90Q02509 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
OC90Q02509 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
OC90Q02509 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
OC90Q02509 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
OC90Q02509 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
OC90Q02509 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
OC90Q02509 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
OC90Q02509 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
OC90Q02509 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
OC90Q02509 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
OC90Q02509 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
OC90Q02509 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
OC90Q02509 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
OC90Q02509 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.5 ms