Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
DSC2Q02487 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
DSC2Q02487 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
DSC2Q02487 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
DSC2Q02487 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
DSC2Q02487 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
DSC2Q02487 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
DSC2Q02487 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
DSC2Q02487 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
DSC2Q02487 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
DSC2Q02487 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
DSC2Q02487 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
DSC2Q02487 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
DSC2Q02487 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
DSC2Q02487 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
DSC2Q02487 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
DSC2Q02487 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
DSC2Q02487 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
DSC2Q02487 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
DSC2Q02487 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
DSC2Q02487 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
DSC2Q02487 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
DSC2Q02487 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
DSC2Q02487 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
DSC2Q02487 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
DSC2Q02487 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
DSC2Q02487 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
DSC2Q02487 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
DSC2Q02487 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
DSC2Q02487 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
DSC2Q02487 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
DSC2Q02487 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
DSC2Q02487 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
DSC2Q02487 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
DSC2Q02487 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
DSC2Q02487 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
DSC2Q02487 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
DSC2Q02487 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
DSC2Q02487 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.07
DSC2Q02487 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
DSC2Q02487 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
DSC2Q02487 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
DSC2Q02487 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
DSC2Q02487 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
DSC2Q02487 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
DSC2Q02487 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
DSC2Q02487 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
DSC2Q02487 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
DSC2Q02487 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
DSC2Q02487 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
DSC2Q02487 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
DSC2Q02487 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
DSC2Q02487 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
DSC2Q02487 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
DSC2Q02487 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
DSC2Q02487 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
DSC2Q02487 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
DSC2Q02487 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
DSC2Q02487 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
DSC2Q02487 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
DSC2Q02487 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
DSC2Q02487 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
DSC2Q02487 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
DSC2Q02487 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
DSC2Q02487 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.05
DSC2Q02487 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
DSC2Q02487 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
DSC2Q02487 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
DSC2Q02487 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
DSC2Q02487 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
DSC2Q02487 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
DSC2Q02487 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
DSC2Q02487 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
DSC2Q02487 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
DSC2Q02487 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
DSC2Q02487 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
DSC2Q02487 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
DSC2Q02487 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
DSC2Q02487 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
DSC2Q02487 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
DSC2Q02487 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
DSC2Q02487 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
DSC2Q02487 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
DSC2Q02487 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
DSC2Q02487 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
DSC2Q02487 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
DSC2Q02487 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
DSC2Q02487 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
DSC2Q02487 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
DSC2Q02487 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
DSC2Q02487 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
DSC2Q02487 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
DSC2Q02487 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
DSC2Q02487 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
DSC2Q02487 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
DSC2Q02487 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
DSC2Q02487 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
DSC2Q02487 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
DSC2Q02487 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
DSC2Q02487 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms