Protein–RNA interactions for Protein: P98174

FGD1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD1P98174 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
FGD1P98174 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
FGD1P98174 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC32.91■■■□□ 2.86
FGD1P98174 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
FGD1P98174 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
FGD1P98174 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.9■■■□□ 2.86
FGD1P98174 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC32.9■■■□□ 2.86
FGD1P98174 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
FGD1P98174 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC32.86■■■□□ 2.85
FGD1P98174 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
FGD1P98174 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
FGD1P98174 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
FGD1P98174 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
FGD1P98174 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
FGD1P98174 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC32.8■■■□□ 2.84
FGD1P98174 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
FGD1P98174 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
FGD1P98174 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
FGD1P98174 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.83
FGD1P98174 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
FGD1P98174 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
FGD1P98174 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
FGD1P98174 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
FGD1P98174 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC32.72■■■□□ 2.83
FGD1P98174 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
FGD1P98174 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
FGD1P98174 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
FGD1P98174 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
FGD1P98174 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
FGD1P98174 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
FGD1P98174 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
FGD1P98174 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC32.65■■■□□ 2.82
FGD1P98174 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC32.65■■■□□ 2.82
FGD1P98174 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
FGD1P98174 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
FGD1P98174 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
FGD1P98174 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
FGD1P98174 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
FGD1P98174 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
FGD1P98174 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC32.57■■■□□ 2.8
FGD1P98174 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
FGD1P98174 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
FGD1P98174 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
FGD1P98174 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
FGD1P98174 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
FGD1P98174 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
FGD1P98174 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
FGD1P98174 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
FGD1P98174 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
FGD1P98174 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
FGD1P98174 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
FGD1P98174 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
FGD1P98174 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
FGD1P98174 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
FGD1P98174 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
FGD1P98174 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
FGD1P98174 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
FGD1P98174 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
FGD1P98174 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
FGD1P98174 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC32.45■■■□□ 2.78
FGD1P98174 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
FGD1P98174 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
FGD1P98174 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
FGD1P98174 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC32.43■■■□□ 2.78
FGD1P98174 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
FGD1P98174 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
FGD1P98174 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
FGD1P98174 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
FGD1P98174 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
FGD1P98174 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
FGD1P98174 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
FGD1P98174 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
FGD1P98174 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
FGD1P98174 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
FGD1P98174 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
FGD1P98174 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC32.38■■■□□ 2.77
FGD1P98174 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
FGD1P98174 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
FGD1P98174 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
FGD1P98174 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC32.35■■■□□ 2.77
FGD1P98174 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
FGD1P98174 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
FGD1P98174 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
FGD1P98174 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC32.32■■■□□ 2.76
FGD1P98174 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
FGD1P98174 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
FGD1P98174 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
FGD1P98174 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
FGD1P98174 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
FGD1P98174 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
FGD1P98174 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
FGD1P98174 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.75
FGD1P98174 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.75
FGD1P98174 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
FGD1P98174 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
FGD1P98174 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
FGD1P98174 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
FGD1P98174 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
FGD1P98174 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
FGD1P98174 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms