Protein–RNA interactions for Protein: P62913

RPL11, 60S ribosomal protein L11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL11P62913 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPL11P62913 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPL11P62913 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPL11P62913 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPL11P62913 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPL11P62913 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPL11P62913 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPL11P62913 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPL11P62913 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPL11P62913 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPL11P62913 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPL11P62913 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RPL11P62913 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RPL11P62913 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
RPL11P62913 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RPL11P62913 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPL11P62913 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPL11P62913 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPL11P62913 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPL11P62913 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPL11P62913 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPL11P62913 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RPL11P62913 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPL11P62913 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPL11P62913 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPL11P62913 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPL11P62913 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPL11P62913 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPL11P62913 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPL11P62913 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
RPL11P62913 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPL11P62913 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPL11P62913 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPL11P62913 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPL11P62913 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPL11P62913 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPL11P62913 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPL11P62913 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPL11P62913 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RPL11P62913 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RPL11P62913 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RPL11P62913 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RPL11P62913 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RPL11P62913 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RPL11P62913 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RPL11P62913 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RPL11P62913 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RPL11P62913 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RPL11P62913 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
RPL11P62913 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RPL11P62913 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RPL11P62913 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RPL11P62913 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RPL11P62913 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPL11P62913 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RPL11P62913 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RPL11P62913 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RPL11P62913 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RPL11P62913 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RPL11P62913 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RPL11P62913 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RPL11P62913 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RPL11P62913 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RPL11P62913 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RPL11P62913 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RPL11P62913 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RPL11P62913 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RPL11P62913 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RPL11P62913 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RPL11P62913 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RPL11P62913 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RPL11P62913 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RPL11P62913 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RPL11P62913 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RPL11P62913 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RPL11P62913 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RPL11P62913 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RPL11P62913 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RPL11P62913 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RPL11P62913 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RPL11P62913 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RPL11P62913 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RPL11P62913 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RPL11P62913 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RPL11P62913 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RPL11P62913 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RPL11P62913 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RPL11P62913 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
RPL11P62913 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
RPL11P62913 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
RPL11P62913 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RPL11P62913 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RPL11P62913 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RPL11P62913 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RPL11P62913 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RPL11P62913 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RPL11P62913 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RPL11P62913 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RPL11P62913 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RPL11P62913 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.7 ms