Protein–RNA interactions for Protein: P61163

ACTR1A, Alpha-centractin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR1AP61163 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ACTR1AP61163 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ACTR1AP61163 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ACTR1AP61163 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ACTR1AP61163 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ACTR1AP61163 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ACTR1AP61163 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ACTR1AP61163 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ACTR1AP61163 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ACTR1AP61163 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ACTR1AP61163 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ACTR1AP61163 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ACTR1AP61163 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ACTR1AP61163 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ACTR1AP61163 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ACTR1AP61163 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ACTR1AP61163 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ACTR1AP61163 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ACTR1AP61163 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ACTR1AP61163 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ACTR1AP61163 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
ACTR1AP61163 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ACTR1AP61163 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ACTR1AP61163 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ACTR1AP61163 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ACTR1AP61163 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ACTR1AP61163 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ACTR1AP61163 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
ACTR1AP61163 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ACTR1AP61163 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ACTR1AP61163 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ACTR1AP61163 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ACTR1AP61163 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
ACTR1AP61163 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ACTR1AP61163 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ACTR1AP61163 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ACTR1AP61163 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ACTR1AP61163 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ACTR1AP61163 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ACTR1AP61163 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ACTR1AP61163 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ACTR1AP61163 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
ACTR1AP61163 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ACTR1AP61163 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ACTR1AP61163 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ACTR1AP61163 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ACTR1AP61163 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ACTR1AP61163 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ACTR1AP61163 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ACTR1AP61163 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ACTR1AP61163 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ACTR1AP61163 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ACTR1AP61163 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ACTR1AP61163 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ACTR1AP61163 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ACTR1AP61163 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ACTR1AP61163 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ACTR1AP61163 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ACTR1AP61163 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ACTR1AP61163 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ACTR1AP61163 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ACTR1AP61163 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ACTR1AP61163 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ACTR1AP61163 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ACTR1AP61163 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
ACTR1AP61163 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ACTR1AP61163 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ACTR1AP61163 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ACTR1AP61163 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ACTR1AP61163 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ACTR1AP61163 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ACTR1AP61163 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ACTR1AP61163 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ACTR1AP61163 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ACTR1AP61163 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
ACTR1AP61163 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
ACTR1AP61163 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ACTR1AP61163 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ACTR1AP61163 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ACTR1AP61163 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ACTR1AP61163 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ACTR1AP61163 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ACTR1AP61163 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
ACTR1AP61163 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ACTR1AP61163 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ACTR1AP61163 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ACTR1AP61163 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
ACTR1AP61163 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
ACTR1AP61163 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ACTR1AP61163 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ACTR1AP61163 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ACTR1AP61163 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ACTR1AP61163 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
ACTR1AP61163 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ACTR1AP61163 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ACTR1AP61163 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ACTR1AP61163 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ACTR1AP61163 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ACTR1AP61163 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ACTR1AP61163 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms