Protein–RNA interactions for Protein: P60508

ERVFRD-1, Syncytin-2, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFRD-1P60508 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ERVFRD-1P60508 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ERVFRD-1P60508 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ERVFRD-1P60508 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ERVFRD-1P60508 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ERVFRD-1P60508 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERVFRD-1P60508 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERVFRD-1P60508 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ERVFRD-1P60508 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERVFRD-1P60508 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ERVFRD-1P60508 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ERVFRD-1P60508 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ERVFRD-1P60508 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ERVFRD-1P60508 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERVFRD-1P60508 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERVFRD-1P60508 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERVFRD-1P60508 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERVFRD-1P60508 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERVFRD-1P60508 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERVFRD-1P60508 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ERVFRD-1P60508 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ERVFRD-1P60508 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ERVFRD-1P60508 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ERVFRD-1P60508 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ERVFRD-1P60508 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERVFRD-1P60508 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERVFRD-1P60508 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERVFRD-1P60508 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERVFRD-1P60508 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ERVFRD-1P60508 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERVFRD-1P60508 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ERVFRD-1P60508 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERVFRD-1P60508 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERVFRD-1P60508 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERVFRD-1P60508 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERVFRD-1P60508 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERVFRD-1P60508 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERVFRD-1P60508 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERVFRD-1P60508 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ERVFRD-1P60508 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERVFRD-1P60508 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERVFRD-1P60508 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERVFRD-1P60508 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERVFRD-1P60508 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERVFRD-1P60508 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERVFRD-1P60508 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERVFRD-1P60508 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERVFRD-1P60508 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERVFRD-1P60508 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERVFRD-1P60508 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ERVFRD-1P60508 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERVFRD-1P60508 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERVFRD-1P60508 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ERVFRD-1P60508 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERVFRD-1P60508 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERVFRD-1P60508 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERVFRD-1P60508 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERVFRD-1P60508 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERVFRD-1P60508 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ERVFRD-1P60508 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ERVFRD-1P60508 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ERVFRD-1P60508 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.23
ERVFRD-1P60508 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERVFRD-1P60508 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERVFRD-1P60508 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERVFRD-1P60508 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERVFRD-1P60508 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ERVFRD-1P60508 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERVFRD-1P60508 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERVFRD-1P60508 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERVFRD-1P60508 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERVFRD-1P60508 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERVFRD-1P60508 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERVFRD-1P60508 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ERVFRD-1P60508 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ERVFRD-1P60508 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ERVFRD-1P60508 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ERVFRD-1P60508 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERVFRD-1P60508 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERVFRD-1P60508 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ERVFRD-1P60508 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ERVFRD-1P60508 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERVFRD-1P60508 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERVFRD-1P60508 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERVFRD-1P60508 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ERVFRD-1P60508 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERVFRD-1P60508 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERVFRD-1P60508 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERVFRD-1P60508 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERVFRD-1P60508 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERVFRD-1P60508 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ERVFRD-1P60508 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERVFRD-1P60508 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERVFRD-1P60508 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ERVFRD-1P60508 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ERVFRD-1P60508 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERVFRD-1P60508 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERVFRD-1P60508 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERVFRD-1P60508 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERVFRD-1P60508 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms