Protein–RNA interactions for Protein: P60508

ERVFRD-1, Syncytin-2, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFRD-1P60508 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ERVFRD-1P60508 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
ERVFRD-1P60508 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
ERVFRD-1P60508 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ERVFRD-1P60508 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ERVFRD-1P60508 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ERVFRD-1P60508 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ERVFRD-1P60508 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ERVFRD-1P60508 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ERVFRD-1P60508 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ERVFRD-1P60508 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
ERVFRD-1P60508 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ERVFRD-1P60508 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ERVFRD-1P60508 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ERVFRD-1P60508 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ERVFRD-1P60508 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ERVFRD-1P60508 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
ERVFRD-1P60508 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ERVFRD-1P60508 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ERVFRD-1P60508 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ERVFRD-1P60508 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ERVFRD-1P60508 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ERVFRD-1P60508 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ERVFRD-1P60508 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ERVFRD-1P60508 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ERVFRD-1P60508 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ERVFRD-1P60508 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ERVFRD-1P60508 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ERVFRD-1P60508 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ERVFRD-1P60508 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ERVFRD-1P60508 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ERVFRD-1P60508 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ERVFRD-1P60508 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ERVFRD-1P60508 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ERVFRD-1P60508 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ERVFRD-1P60508 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ERVFRD-1P60508 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ERVFRD-1P60508 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ERVFRD-1P60508 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ERVFRD-1P60508 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ERVFRD-1P60508 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ERVFRD-1P60508 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ERVFRD-1P60508 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ERVFRD-1P60508 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ERVFRD-1P60508 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ERVFRD-1P60508 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ERVFRD-1P60508 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ERVFRD-1P60508 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ERVFRD-1P60508 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ERVFRD-1P60508 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ERVFRD-1P60508 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ERVFRD-1P60508 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ERVFRD-1P60508 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ERVFRD-1P60508 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ERVFRD-1P60508 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ERVFRD-1P60508 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ERVFRD-1P60508 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ERVFRD-1P60508 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ERVFRD-1P60508 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ERVFRD-1P60508 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ERVFRD-1P60508 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
ERVFRD-1P60508 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ERVFRD-1P60508 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ERVFRD-1P60508 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERVFRD-1P60508 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ERVFRD-1P60508 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ERVFRD-1P60508 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ERVFRD-1P60508 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ERVFRD-1P60508 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ERVFRD-1P60508 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ERVFRD-1P60508 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ERVFRD-1P60508 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ERVFRD-1P60508 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ERVFRD-1P60508 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ERVFRD-1P60508 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ERVFRD-1P60508 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ERVFRD-1P60508 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ERVFRD-1P60508 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ERVFRD-1P60508 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ERVFRD-1P60508 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ERVFRD-1P60508 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ERVFRD-1P60508 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ERVFRD-1P60508 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ERVFRD-1P60508 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ERVFRD-1P60508 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ERVFRD-1P60508 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERVFRD-1P60508 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERVFRD-1P60508 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERVFRD-1P60508 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERVFRD-1P60508 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ERVFRD-1P60508 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ERVFRD-1P60508 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ERVFRD-1P60508 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ERVFRD-1P60508 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ERVFRD-1P60508 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ERVFRD-1P60508 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ERVFRD-1P60508 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ERVFRD-1P60508 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ERVFRD-1P60508 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ERVFRD-1P60508 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms