Protein–RNA interactions for Protein: P55212

CASP6, Caspase-6, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP6P55212 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CASP6P55212 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CASP6P55212 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CASP6P55212 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CASP6P55212 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CASP6P55212 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CASP6P55212 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CASP6P55212 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CASP6P55212 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CASP6P55212 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CASP6P55212 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CASP6P55212 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CASP6P55212 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CASP6P55212 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CASP6P55212 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CASP6P55212 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CASP6P55212 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CASP6P55212 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CASP6P55212 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CASP6P55212 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CASP6P55212 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CASP6P55212 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CASP6P55212 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CASP6P55212 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CASP6P55212 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CASP6P55212 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CASP6P55212 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CASP6P55212 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CASP6P55212 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CASP6P55212 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CASP6P55212 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CASP6P55212 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CASP6P55212 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CASP6P55212 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CASP6P55212 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CASP6P55212 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CASP6P55212 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CASP6P55212 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CASP6P55212 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CASP6P55212 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CASP6P55212 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CASP6P55212 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CASP6P55212 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CASP6P55212 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CASP6P55212 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CASP6P55212 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CASP6P55212 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CASP6P55212 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CASP6P55212 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CASP6P55212 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CASP6P55212 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CASP6P55212 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CASP6P55212 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CASP6P55212 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CASP6P55212 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CASP6P55212 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CASP6P55212 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CASP6P55212 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CASP6P55212 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CASP6P55212 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CASP6P55212 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CASP6P55212 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CASP6P55212 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CASP6P55212 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CASP6P55212 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CASP6P55212 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CASP6P55212 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CASP6P55212 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CASP6P55212 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CASP6P55212 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CASP6P55212 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CASP6P55212 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CASP6P55212 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CASP6P55212 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CASP6P55212 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CASP6P55212 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CASP6P55212 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CASP6P55212 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CASP6P55212 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CASP6P55212 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CASP6P55212 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CASP6P55212 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CASP6P55212 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CASP6P55212 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CASP6P55212 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CASP6P55212 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CASP6P55212 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CASP6P55212 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CASP6P55212 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CASP6P55212 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CASP6P55212 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CASP6P55212 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CASP6P55212 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CASP6P55212 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CASP6P55212 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CASP6P55212 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CASP6P55212 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CASP6P55212 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CASP6P55212 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CASP6P55212 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.7 ms