Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TTPAP49638 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TTPAP49638 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TTPAP49638 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TTPAP49638 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TTPAP49638 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TTPAP49638 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TTPAP49638 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TTPAP49638 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TTPAP49638 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TTPAP49638 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TTPAP49638 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TTPAP49638 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TTPAP49638 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TTPAP49638 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TTPAP49638 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
TTPAP49638 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
TTPAP49638 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TTPAP49638 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TTPAP49638 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TTPAP49638 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TTPAP49638 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TTPAP49638 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TTPAP49638 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TTPAP49638 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TTPAP49638 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TTPAP49638 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TTPAP49638 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TTPAP49638 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TTPAP49638 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TTPAP49638 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TTPAP49638 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TTPAP49638 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TTPAP49638 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TTPAP49638 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TTPAP49638 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TTPAP49638 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TTPAP49638 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TTPAP49638 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TTPAP49638 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
TTPAP49638 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TTPAP49638 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TTPAP49638 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TTPAP49638 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TTPAP49638 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TTPAP49638 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TTPAP49638 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TTPAP49638 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TTPAP49638 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TTPAP49638 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TTPAP49638 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
TTPAP49638 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TTPAP49638 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TTPAP49638 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TTPAP49638 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TTPAP49638 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TTPAP49638 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TTPAP49638 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TTPAP49638 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TTPAP49638 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TTPAP49638 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TTPAP49638 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TTPAP49638 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TTPAP49638 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TTPAP49638 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TTPAP49638 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TTPAP49638 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TTPAP49638 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TTPAP49638 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TTPAP49638 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TTPAP49638 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TTPAP49638 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TTPAP49638 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TTPAP49638 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TTPAP49638 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TTPAP49638 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TTPAP49638 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TTPAP49638 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TTPAP49638 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TTPAP49638 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TTPAP49638 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
TTPAP49638 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TTPAP49638 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TTPAP49638 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TTPAP49638 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TTPAP49638 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TTPAP49638 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TTPAP49638 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TTPAP49638 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TTPAP49638 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TTPAP49638 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TTPAP49638 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TTPAP49638 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TTPAP49638 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TTPAP49638 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TTPAP49638 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TTPAP49638 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TTPAP49638 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
TTPAP49638 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TTPAP49638 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
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