Protein–RNA interactions for Protein: P48169

GABRA4, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA4P48169 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GABRA4P48169 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
GABRA4P48169 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GABRA4P48169 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
GABRA4P48169 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
GABRA4P48169 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GABRA4P48169 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GABRA4P48169 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GABRA4P48169 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GABRA4P48169 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
GABRA4P48169 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GABRA4P48169 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GABRA4P48169 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GABRA4P48169 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GABRA4P48169 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GABRA4P48169 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
GABRA4P48169 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GABRA4P48169 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GABRA4P48169 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GABRA4P48169 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GABRA4P48169 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GABRA4P48169 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GABRA4P48169 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GABRA4P48169 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GABRA4P48169 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GABRA4P48169 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GABRA4P48169 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GABRA4P48169 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
GABRA4P48169 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GABRA4P48169 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
GABRA4P48169 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GABRA4P48169 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GABRA4P48169 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GABRA4P48169 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GABRA4P48169 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
GABRA4P48169 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GABRA4P48169 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GABRA4P48169 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GABRA4P48169 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GABRA4P48169 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GABRA4P48169 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GABRA4P48169 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GABRA4P48169 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GABRA4P48169 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GABRA4P48169 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GABRA4P48169 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GABRA4P48169 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GABRA4P48169 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GABRA4P48169 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
GABRA4P48169 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GABRA4P48169 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GABRA4P48169 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GABRA4P48169 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GABRA4P48169 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GABRA4P48169 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GABRA4P48169 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GABRA4P48169 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GABRA4P48169 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GABRA4P48169 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GABRA4P48169 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GABRA4P48169 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GABRA4P48169 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GABRA4P48169 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GABRA4P48169 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GABRA4P48169 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GABRA4P48169 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
GABRA4P48169 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
GABRA4P48169 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GABRA4P48169 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GABRA4P48169 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GABRA4P48169 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GABRA4P48169 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GABRA4P48169 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GABRA4P48169 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GABRA4P48169 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GABRA4P48169 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GABRA4P48169 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GABRA4P48169 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GABRA4P48169 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GABRA4P48169 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GABRA4P48169 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GABRA4P48169 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GABRA4P48169 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
GABRA4P48169 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GABRA4P48169 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GABRA4P48169 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GABRA4P48169 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GABRA4P48169 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GABRA4P48169 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GABRA4P48169 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GABRA4P48169 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GABRA4P48169 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GABRA4P48169 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GABRA4P48169 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GABRA4P48169 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GABRA4P48169 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GABRA4P48169 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GABRA4P48169 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GABRA4P48169 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GABRA4P48169 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.5 ms