Protein–RNA interactions for Protein: P48169

GABRA4, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA4P48169 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC32.9■■■□□ 2.86
GABRA4P48169 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
GABRA4P48169 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
GABRA4P48169 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC31.88■■■□□ 2.69
GABRA4P48169 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
GABRA4P48169 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
GABRA4P48169 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC31.8■■■□□ 2.68
GABRA4P48169 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.3■■■□□ 2.6
GABRA4P48169 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
GABRA4P48169 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
GABRA4P48169 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
GABRA4P48169 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
GABRA4P48169 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
GABRA4P48169 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
GABRA4P48169 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
GABRA4P48169 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
GABRA4P48169 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
GABRA4P48169 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
GABRA4P48169 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC30.35■■■□□ 2.45
GABRA4P48169 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
GABRA4P48169 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
GABRA4P48169 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
GABRA4P48169 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
GABRA4P48169 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
GABRA4P48169 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
GABRA4P48169 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
GABRA4P48169 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
GABRA4P48169 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
GABRA4P48169 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
GABRA4P48169 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
GABRA4P48169 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
GABRA4P48169 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
GABRA4P48169 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
GABRA4P48169 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
GABRA4P48169 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
GABRA4P48169 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
GABRA4P48169 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
GABRA4P48169 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
GABRA4P48169 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
GABRA4P48169 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
GABRA4P48169 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
GABRA4P48169 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
GABRA4P48169 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
GABRA4P48169 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
GABRA4P48169 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
GABRA4P48169 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
GABRA4P48169 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
GABRA4P48169 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
GABRA4P48169 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
GABRA4P48169 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
GABRA4P48169 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
GABRA4P48169 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.19
GABRA4P48169 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
GABRA4P48169 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
GABRA4P48169 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
GABRA4P48169 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
GABRA4P48169 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
GABRA4P48169 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
GABRA4P48169 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
GABRA4P48169 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
GABRA4P48169 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
GABRA4P48169 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GABRA4P48169 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GABRA4P48169 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GABRA4P48169 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GABRA4P48169 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
GABRA4P48169 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GABRA4P48169 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GABRA4P48169 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
GABRA4P48169 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GABRA4P48169 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
GABRA4P48169 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GABRA4P48169 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GABRA4P48169 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
GABRA4P48169 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GABRA4P48169 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GABRA4P48169 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
GABRA4P48169 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
GABRA4P48169 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
GABRA4P48169 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GABRA4P48169 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
GABRA4P48169 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
GABRA4P48169 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GABRA4P48169 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GABRA4P48169 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
GABRA4P48169 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GABRA4P48169 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GABRA4P48169 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GABRA4P48169 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GABRA4P48169 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
GABRA4P48169 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GABRA4P48169 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GABRA4P48169 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
GABRA4P48169 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
GABRA4P48169 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
GABRA4P48169 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GABRA4P48169 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GABRA4P48169 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
GABRA4P48169 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
GABRA4P48169 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms