Protein–RNA interactions for Protein: P38435

GGCX, Vitamin K-dependent gamma-carboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGCXP38435 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
GGCXP38435 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
GGCXP38435 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
GGCXP38435 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
GGCXP38435 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
GGCXP38435 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
GGCXP38435 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
GGCXP38435 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
GGCXP38435 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
GGCXP38435 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
GGCXP38435 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
GGCXP38435 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
GGCXP38435 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
GGCXP38435 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
GGCXP38435 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
GGCXP38435 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
GGCXP38435 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
GGCXP38435 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
GGCXP38435 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
GGCXP38435 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
GGCXP38435 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
GGCXP38435 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
GGCXP38435 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
GGCXP38435 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
GGCXP38435 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
GGCXP38435 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
GGCXP38435 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
GGCXP38435 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
GGCXP38435 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
GGCXP38435 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
GGCXP38435 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
GGCXP38435 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
GGCXP38435 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
GGCXP38435 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
GGCXP38435 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
GGCXP38435 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
GGCXP38435 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
GGCXP38435 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
GGCXP38435 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
GGCXP38435 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
GGCXP38435 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
GGCXP38435 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
GGCXP38435 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
GGCXP38435 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
GGCXP38435 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
GGCXP38435 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
GGCXP38435 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
GGCXP38435 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
GGCXP38435 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
GGCXP38435 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
GGCXP38435 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
GGCXP38435 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
GGCXP38435 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
GGCXP38435 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
GGCXP38435 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
GGCXP38435 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
GGCXP38435 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
GGCXP38435 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
GGCXP38435 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
GGCXP38435 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
GGCXP38435 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
GGCXP38435 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
GGCXP38435 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
GGCXP38435 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
GGCXP38435 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
GGCXP38435 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
GGCXP38435 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
GGCXP38435 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
GGCXP38435 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
GGCXP38435 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
GGCXP38435 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
GGCXP38435 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
GGCXP38435 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
GGCXP38435 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
GGCXP38435 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
GGCXP38435 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
GGCXP38435 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
GGCXP38435 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
GGCXP38435 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
GGCXP38435 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
GGCXP38435 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
GGCXP38435 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
GGCXP38435 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
GGCXP38435 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
GGCXP38435 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
GGCXP38435 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
GGCXP38435 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
GGCXP38435 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
GGCXP38435 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
GGCXP38435 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
GGCXP38435 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
GGCXP38435 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
GGCXP38435 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
GGCXP38435 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
GGCXP38435 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
GGCXP38435 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
GGCXP38435 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
GGCXP38435 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
GGCXP38435 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
GGCXP38435 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms