Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PPARGP37231 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PPARGP37231 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PPARGP37231 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
PPARGP37231 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PPARGP37231 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PPARGP37231 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PPARGP37231 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PPARGP37231 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PPARGP37231 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PPARGP37231 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PPARGP37231 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PPARGP37231 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PPARGP37231 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PPARGP37231 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PPARGP37231 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PPARGP37231 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PPARGP37231 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PPARGP37231 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PPARGP37231 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PPARGP37231 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PPARGP37231 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PPARGP37231 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PPARGP37231 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PPARGP37231 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PPARGP37231 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PPARGP37231 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PPARGP37231 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PPARGP37231 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PPARGP37231 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PPARGP37231 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PPARGP37231 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PPARGP37231 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PPARGP37231 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PPARGP37231 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PPARGP37231 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PPARGP37231 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
PPARGP37231 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PPARGP37231 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PPARGP37231 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PPARGP37231 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PPARGP37231 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PPARGP37231 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PPARGP37231 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PPARGP37231 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PPARGP37231 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PPARGP37231 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PPARGP37231 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PPARGP37231 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PPARGP37231 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PPARGP37231 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PPARGP37231 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PPARGP37231 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PPARGP37231 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PPARGP37231 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PPARGP37231 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
PPARGP37231 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PPARGP37231 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PPARGP37231 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PPARGP37231 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PPARGP37231 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PPARGP37231 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PPARGP37231 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PPARGP37231 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PPARGP37231 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PPARGP37231 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PPARGP37231 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PPARGP37231 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PPARGP37231 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PPARGP37231 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PPARGP37231 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PPARGP37231 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PPARGP37231 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PPARGP37231 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PPARGP37231 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PPARGP37231 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PPARGP37231 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PPARGP37231 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PPARGP37231 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PPARGP37231 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PPARGP37231 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PPARGP37231 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PPARGP37231 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PPARGP37231 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PPARGP37231 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PPARGP37231 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PPARGP37231 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PPARGP37231 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
PPARGP37231 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.96
PPARGP37231 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PPARGP37231 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PPARGP37231 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PPARGP37231 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
PPARGP37231 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PPARGP37231 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PPARGP37231 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PPARGP37231 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PPARGP37231 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PPARGP37231 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PPARGP37231 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms