Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GPC1P35052 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GPC1P35052 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GPC1P35052 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
GPC1P35052 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GPC1P35052 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GPC1P35052 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GPC1P35052 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GPC1P35052 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GPC1P35052 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GPC1P35052 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GPC1P35052 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GPC1P35052 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GPC1P35052 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GPC1P35052 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GPC1P35052 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GPC1P35052 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GPC1P35052 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GPC1P35052 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GPC1P35052 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
GPC1P35052 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GPC1P35052 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GPC1P35052 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
GPC1P35052 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GPC1P35052 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GPC1P35052 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GPC1P35052 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GPC1P35052 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GPC1P35052 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GPC1P35052 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GPC1P35052 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
GPC1P35052 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GPC1P35052 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
GPC1P35052 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GPC1P35052 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GPC1P35052 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GPC1P35052 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GPC1P35052 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GPC1P35052 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GPC1P35052 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GPC1P35052 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GPC1P35052 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GPC1P35052 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GPC1P35052 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GPC1P35052 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GPC1P35052 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GPC1P35052 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GPC1P35052 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GPC1P35052 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GPC1P35052 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GPC1P35052 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GPC1P35052 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GPC1P35052 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GPC1P35052 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GPC1P35052 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GPC1P35052 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GPC1P35052 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GPC1P35052 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
GPC1P35052 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GPC1P35052 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GPC1P35052 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GPC1P35052 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GPC1P35052 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GPC1P35052 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GPC1P35052 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GPC1P35052 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
GPC1P35052 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GPC1P35052 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GPC1P35052 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GPC1P35052 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GPC1P35052 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GPC1P35052 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GPC1P35052 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GPC1P35052 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GPC1P35052 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GPC1P35052 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GPC1P35052 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GPC1P35052 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GPC1P35052 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GPC1P35052 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GPC1P35052 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GPC1P35052 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GPC1P35052 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GPC1P35052 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GPC1P35052 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GPC1P35052 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GPC1P35052 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GPC1P35052 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GPC1P35052 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GPC1P35052 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GPC1P35052 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
GPC1P35052 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GPC1P35052 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GPC1P35052 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GPC1P35052 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GPC1P35052 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GPC1P35052 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GPC1P35052 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GPC1P35052 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GPC1P35052 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms