Protein–RNA interactions for Protein: P31483

TIA1, Nucleolysin TIA-1 isoform p40, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 386 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIA1P31483 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.244e-25■■■■■ 54.4
TIA1P31483 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.064e-25■■■■■ 54.4
TIA1P31483 DYNLL1-211ENST00000552870 595 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.674e-25■■■■■ 54.4
TIA1P31483 CAPZA1-201ENST00000263168 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.82e-19■■■■■ 54.4
TIA1P31483 DYNLL1-202ENST00000392508 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.034e-25■■■■■ 54.4
TIA1P31483 CAPZA1-204ENST00000476936 867 ntTSL 34.99□□□□□ -1.612e-19■■■■■ 54.4
TIA1P31483 DYNLL1-210ENST00000552316 670 nt4.83□□□□□ -1.644e-25■■■■■ 54.4
TIA1P31483 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.214e-7■■■■■ 53.6
TIA1P31483 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.244e-7■■■■■ 53.6
TIA1P31483 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.314e-7■■■■■ 53.6
TIA1P31483 PSME1-210ENST00000561435 945 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.814e-7■■■■■ 53.6
TIA1P31483 PSME1-206ENST00000559741 763 ntTSL 39.3□□□□□ -0.924e-7■■■■■ 53.6
TIA1P31483 PSME1-204ENST00000558112 651 ntTSL 58.3□□□□□ -1.084e-7■■■■■ 53.6
TIA1P31483 AES-206ENST00000586742 1666 ntTSL 317.45■□□□□ 0.385e-10■■■■■ 53.3
TIA1P31483 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.225e-10■■■■■ 53.3
TIA1P31483 AES-212ENST00000592414 3274 ntTSL 211.78□□□□□ -0.525e-10■■■■■ 53.3
TIA1P31483 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.251e-6■■■■■ 53.1
TIA1P31483 DEK-204ENST00000505224 1372 ntTSL 213.37□□□□□ -0.271e-6■■■■■ 53.1
TIA1P31483 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.531e-15■■■■■ 52.9
TIA1P31483 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.251e-15■■■■■ 52.9
TIA1P31483 GFPT1-204ENST00000494201 625 ntTSL 56.06□□□□□ -1.445e-17■■■■■ 52.6
TIA1P31483 MACF1-228ENST00000528611 380 ntTSL 35.89□□□□□ -1.471e-14■■■■■ 52.4
TIA1P31483 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.13e-13■■■■■ 52.3
TIA1P31483 CASC3-202ENST00000394114 2792 ntTSL 25.56□□□□□ -1.523e-13■■■■■ 52.3
TIA1P31483 PTP4A1-205ENST00000626021 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.781e-9■■■■■ 52.3
TIA1P31483 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.081e-14■■■■■ 52.3
TIA1P31483 F2-205ENST00000530231 1849 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.251e-14■■■■■ 52.3
TIA1P31483 SEC23B-201ENST00000262544 3176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.436e-15■■■■■ 51.7
TIA1P31483 SEC23B-204ENST00000377475 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.646e-15■■■■■ 51.7
TIA1P31483 SEC23B-202ENST00000336714 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.756e-15■■■■■ 51.7
TIA1P31483 SEC23B-203ENST00000377465 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.786e-15■■■■■ 51.7
TIA1P31483 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.684e-18■■■■■ 51.7
TIA1P31483 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.184e-18■■■■■ 51.7
TIA1P31483 MRFAP1-204ENST00000512914 1982 nt15.44■□□□□ 0.064e-18■■■■■ 51.7
TIA1P31483 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.234e-18■■■■■ 51.7
TIA1P31483 LMNB1-208ENST00000504788 1801 ntTSL 24.65□□□□□ -1.662e-18■■■■■ 51.7
TIA1P31483 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.012e-10■■■■■ 51.3
TIA1P31483 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.082e-10■■■■■ 51.3
TIA1P31483 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.322e-10■■■■■ 51.3
TIA1P31483 IQCB1-203ENST00000393650 2253 ntTSL 514.48□□□□□ -0.097e-16■■■■■ 51.3
TIA1P31483 IQCB1-202ENST00000349820 1919 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.397e-16■■■■■ 51.3
TIA1P31483 IQCB1-201ENST00000310864 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.687e-16■■■■■ 51.3
TIA1P31483 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.623e-6■■■■■ 51.2
TIA1P31483 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.183e-6■■■■■ 51.2
TIA1P31483 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.284e-11■■■■■ 51.1
TIA1P31483 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.434e-11■■■■■ 51.1
TIA1P31483 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.394e-11■■■■■ 51.1
TIA1P31483 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.154e-11■■■■■ 51.1
TIA1P31483 DDX42-204ENST00000577940 1427 ntTSL 57.78□□□□□ -1.164e-11■■■■■ 51.1
TIA1P31483 DDX42-203ENST00000457800 3323 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.324e-11■■■■■ 51.1
TIA1P31483 DDX42-218ENST00000584261 510 ntTSL 35.67□□□□□ -1.54e-11■■■■■ 51.1
TIA1P31483 DDX42-206ENST00000578137 857 ntTSL 33.43□□□□□ -1.864e-11■■■■■ 51.1
TIA1P31483 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.693e-8■■■■■ 50.9
TIA1P31483 IDH1-201ENST00000345146 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.663e-8■■■■■ 50.9
TIA1P31483 IDH1-203ENST00000415913 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.833e-8■■■■■ 50.9
TIA1P31483 ATP6V1G1-201ENST00000374050 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.655e-13■■■■■ 50.9
TIA1P31483 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.233e-7■■■■■ 50.7
TIA1P31483 RELN-203ENST00000428762 11571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.852e-9■■■■■ 50.1
TIA1P31483 RELN-202ENST00000424685 11571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.852e-9■■■■■ 50.1
TIA1P31483 RELN-201ENST00000343529 11565 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.852e-9■■■■■ 50.1
TIA1P31483 LYZ-201ENST00000261267 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.082e-7■■■■■ 49.6
TIA1P31483 CFL2-204ENST00000554470 1387 ntTSL 1 (best)18.47■□□□□ 0.551e-17■■■■■ 49.6
TIA1P31483 CFL2-203ENST00000422678 1223 ntTSL 29.4□□□□□ -0.91e-17■■■■■ 49.6
TIA1P31483 CFL2-201ENST00000298159 6747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.561e-17■■■■■ 49.6
TIA1P31483 CFL2-202ENST00000341223 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.741e-17■■■■■ 49.6
TIA1P31483 TMED10-204ENST00000555873 1161 ntTSL 1 (best)12.33□□□□□ -0.444e-23■■■■■ 49.4
TIA1P31483 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.082e-14■■■■■ 49.3
TIA1P31483 MCM4-215ENST00000523944 4105 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.442e-14■■■■■ 49.3
TIA1P31483 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.963e-8■■■■■ 49.2
TIA1P31483 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.863e-8■■■■■ 49.2
TIA1P31483 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.223e-8■■■■■ 49.2
TIA1P31483 JUND-202ENST00000600972 500 ntTSL 224.31■■□□□ 1.482e-9■■■■■ 49.1
TIA1P31483 FGL1-206ENST00000518650 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.598e-10■■■■■ 49
TIA1P31483 GTF2F2-201ENST00000340473 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.384e-14■■■■■ 49
TIA1P31483 SNRPE-206ENST00000483099 967 ntTSL 217.58■□□□□ 0.48e-19■■■■■ 49
TIA1P31483 SNRPE-202ENST00000414487 942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.988e-19■■■■■ 49
TIA1P31483 SNRPE-205ENST00000475035 532 ntTSL 1 (best)7.95□□□□□ -1.148e-19■■■■■ 49
TIA1P31483 SNRPE-204ENST00000470492 478 ntTSL 35.06□□□□□ -1.68e-19■■■■■ 49
TIA1P31483 SNRPE-201ENST00000367208 355 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.768e-19■■■■■ 49
TIA1P31483 PSMA7-205ENST00000484488 1023 ntTSL 321.73■■□□□ 1.076e-7■■■■■ 48.9
TIA1P31483 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.236e-7■■■■■ 48.9
TIA1P31483 PSMA7-204ENST00000442551 685 ntTSL 314.16□□□□□ -0.146e-7■■■■■ 48.9
TIA1P31483 SLC2A3-209ENST00000543435 383 ntTSL 39.26□□□□□ -0.937e-15■■■■■ 48.9
TIA1P31483 RPL27A-203ENST00000525981 297 ntTSL 513.22□□□□□ -0.294e-14■■■■■ 48.7
TIA1P31483 RPL27A-204ENST00000526562 519 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.784e-14■■■■■ 48.7
TIA1P31483 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.315e-12■■■■■ 48.5
TIA1P31483 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.185e-12■■■■■ 48.5
TIA1P31483 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.265e-12■■■■■ 48.5
TIA1P31483 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.723e-17■■■■■ 48.4
TIA1P31483 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.183e-17■■■■■ 48.4
TIA1P31483 TBCB-203ENST00000468156 630 ntTSL 216.02■□□□□ 0.163e-17■■■■■ 48.4
TIA1P31483 TBCB-207ENST00000586868 466 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.743e-17■■■■■ 48.4
TIA1P31483 ARPP19-206ENST00000564163 718 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.753e-17■■■■■ 48.4
TIA1P31483 ARPP19-212ENST00000569281 661 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.47□□□□□ -0.893e-17■■■■■ 48.4
TIA1P31483 ARPP19-203ENST00000561971 799 ntTSL 3 BASIC8.57□□□□□ -1.043e-17■■■■■ 48.4
TIA1P31483 ARPP19-209ENST00000567669 745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.11□□□□□ -1.113e-17■■■■■ 48.4
TIA1P31483 ARPP19-213ENST00000569723 550 ntTSL 4 BASIC7.82□□□□□ -1.163e-17■■■■■ 48.4
TIA1P31483 ARPP19-204ENST00000563277 955 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.643e-17■■■■■ 48.4
TIA1P31483 ARPP19-205ENST00000563566 568 ntTSL 4 BASIC4.67□□□□□ -1.663e-17■■■■■ 48.4
TIA1P31483 ARPP19-211ENST00000568196 1489 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.863e-17■■■■■ 48.4
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