Protein–RNA interactions for Protein: P26640

VARS, Valine--tRNA ligase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VARSP26640 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
VARSP26640 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
VARSP26640 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
VARSP26640 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
VARSP26640 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
VARSP26640 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
VARSP26640 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
VARSP26640 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
VARSP26640 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
VARSP26640 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
VARSP26640 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
VARSP26640 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
VARSP26640 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
VARSP26640 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
VARSP26640 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
VARSP26640 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
VARSP26640 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
VARSP26640 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
VARSP26640 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
VARSP26640 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
VARSP26640 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
VARSP26640 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
VARSP26640 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
VARSP26640 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
VARSP26640 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
VARSP26640 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
VARSP26640 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
VARSP26640 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
VARSP26640 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
VARSP26640 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
VARSP26640 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
VARSP26640 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
VARSP26640 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
VARSP26640 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
VARSP26640 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
VARSP26640 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
VARSP26640 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
VARSP26640 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
VARSP26640 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
VARSP26640 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
VARSP26640 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
VARSP26640 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
VARSP26640 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
VARSP26640 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
VARSP26640 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
VARSP26640 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
VARSP26640 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
VARSP26640 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
VARSP26640 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
VARSP26640 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
VARSP26640 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
VARSP26640 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
VARSP26640 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
VARSP26640 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
VARSP26640 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
VARSP26640 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
VARSP26640 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
VARSP26640 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
VARSP26640 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
VARSP26640 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
VARSP26640 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
VARSP26640 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
VARSP26640 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
VARSP26640 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
VARSP26640 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
VARSP26640 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
VARSP26640 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
VARSP26640 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
VARSP26640 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
VARSP26640 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
VARSP26640 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
VARSP26640 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
VARSP26640 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
VARSP26640 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
VARSP26640 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
VARSP26640 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
VARSP26640 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
VARSP26640 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
VARSP26640 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
VARSP26640 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
VARSP26640 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
VARSP26640 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
VARSP26640 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
VARSP26640 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
VARSP26640 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
VARSP26640 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
VARSP26640 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
VARSP26640 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
VARSP26640 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
VARSP26640 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
VARSP26640 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
VARSP26640 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
VARSP26640 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
VARSP26640 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
VARSP26640 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
VARSP26640 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
VARSP26640 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
VARSP26640 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
VARSP26640 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
VARSP26640 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms