Protein–RNA interactions for Protein: P23771

GATA3, Trans-acting T-cell-specific transcription factor GATA-3, humanhuman

Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA3P23771 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GATA3P23771 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GATA3P23771 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GATA3P23771 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GATA3P23771 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GATA3P23771 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GATA3P23771 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GATA3P23771 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
GATA3P23771 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GATA3P23771 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GATA3P23771 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GATA3P23771 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GATA3P23771 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GATA3P23771 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GATA3P23771 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GATA3P23771 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GATA3P23771 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GATA3P23771 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GATA3P23771 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GATA3P23771 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GATA3P23771 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
GATA3P23771 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
GATA3P23771 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GATA3P23771 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GATA3P23771 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GATA3P23771 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GATA3P23771 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GATA3P23771 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GATA3P23771 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GATA3P23771 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GATA3P23771 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GATA3P23771 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GATA3P23771 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GATA3P23771 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GATA3P23771 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GATA3P23771 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GATA3P23771 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
GATA3P23771 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GATA3P23771 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
GATA3P23771 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GATA3P23771 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GATA3P23771 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GATA3P23771 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GATA3P23771 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GATA3P23771 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GATA3P23771 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GATA3P23771 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
GATA3P23771 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GATA3P23771 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GATA3P23771 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GATA3P23771 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GATA3P23771 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GATA3P23771 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GATA3P23771 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GATA3P23771 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GATA3P23771 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GATA3P23771 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GATA3P23771 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GATA3P23771 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GATA3P23771 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GATA3P23771 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GATA3P23771 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GATA3P23771 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GATA3P23771 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GATA3P23771 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GATA3P23771 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GATA3P23771 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GATA3P23771 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GATA3P23771 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GATA3P23771 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GATA3P23771 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GATA3P23771 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GATA3P23771 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
GATA3P23771 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GATA3P23771 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GATA3P23771 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GATA3P23771 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GATA3P23771 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GATA3P23771 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GATA3P23771 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GATA3P23771 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GATA3P23771 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
GATA3P23771 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GATA3P23771 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GATA3P23771 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GATA3P23771 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GATA3P23771 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GATA3P23771 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GATA3P23771 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GATA3P23771 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GATA3P23771 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GATA3P23771 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GATA3P23771 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GATA3P23771 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GATA3P23771 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GATA3P23771 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GATA3P23771 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GATA3P23771 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GATA3P23771 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GATA3P23771 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms