Protein–RNA interactions for Protein: P23771

GATA3, Trans-acting T-cell-specific transcription factor GATA-3, humanhuman

Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA3P23771 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
GATA3P23771 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GATA3P23771 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GATA3P23771 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GATA3P23771 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GATA3P23771 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GATA3P23771 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GATA3P23771 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
GATA3P23771 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GATA3P23771 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GATA3P23771 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GATA3P23771 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GATA3P23771 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GATA3P23771 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GATA3P23771 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GATA3P23771 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
GATA3P23771 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GATA3P23771 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GATA3P23771 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GATA3P23771 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GATA3P23771 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GATA3P23771 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GATA3P23771 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GATA3P23771 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GATA3P23771 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GATA3P23771 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GATA3P23771 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GATA3P23771 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GATA3P23771 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GATA3P23771 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GATA3P23771 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GATA3P23771 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GATA3P23771 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GATA3P23771 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GATA3P23771 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GATA3P23771 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
GATA3P23771 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GATA3P23771 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
GATA3P23771 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GATA3P23771 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GATA3P23771 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GATA3P23771 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
GATA3P23771 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GATA3P23771 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GATA3P23771 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GATA3P23771 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GATA3P23771 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GATA3P23771 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GATA3P23771 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GATA3P23771 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GATA3P23771 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GATA3P23771 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GATA3P23771 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GATA3P23771 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
GATA3P23771 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GATA3P23771 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GATA3P23771 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GATA3P23771 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GATA3P23771 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GATA3P23771 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
GATA3P23771 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GATA3P23771 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GATA3P23771 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GATA3P23771 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GATA3P23771 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GATA3P23771 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GATA3P23771 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GATA3P23771 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GATA3P23771 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GATA3P23771 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GATA3P23771 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GATA3P23771 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GATA3P23771 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GATA3P23771 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GATA3P23771 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GATA3P23771 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GATA3P23771 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GATA3P23771 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GATA3P23771 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GATA3P23771 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GATA3P23771 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GATA3P23771 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GATA3P23771 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GATA3P23771 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GATA3P23771 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GATA3P23771 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GATA3P23771 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GATA3P23771 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GATA3P23771 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GATA3P23771 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GATA3P23771 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GATA3P23771 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GATA3P23771 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GATA3P23771 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
GATA3P23771 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GATA3P23771 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GATA3P23771 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GATA3P23771 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GATA3P23771 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GATA3P23771 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.3 ms