Protein–RNA interactions for Protein: P22674

CCNO, Cyclin-O, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNOP22674 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCNOP22674 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCNOP22674 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCNOP22674 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCNOP22674 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCNOP22674 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCNOP22674 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCNOP22674 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCNOP22674 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCNOP22674 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCNOP22674 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCNOP22674 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCNOP22674 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCNOP22674 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCNOP22674 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCNOP22674 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCNOP22674 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCNOP22674 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCNOP22674 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCNOP22674 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCNOP22674 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCNOP22674 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCNOP22674 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCNOP22674 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCNOP22674 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCNOP22674 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCNOP22674 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCNOP22674 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCNOP22674 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCNOP22674 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCNOP22674 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCNOP22674 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCNOP22674 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCNOP22674 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCNOP22674 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCNOP22674 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCNOP22674 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCNOP22674 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCNOP22674 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCNOP22674 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCNOP22674 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CCNOP22674 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCNOP22674 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCNOP22674 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCNOP22674 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCNOP22674 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCNOP22674 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCNOP22674 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCNOP22674 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCNOP22674 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCNOP22674 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CCNOP22674 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCNOP22674 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCNOP22674 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCNOP22674 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCNOP22674 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCNOP22674 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCNOP22674 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCNOP22674 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCNOP22674 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCNOP22674 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCNOP22674 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCNOP22674 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCNOP22674 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCNOP22674 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCNOP22674 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCNOP22674 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCNOP22674 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCNOP22674 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCNOP22674 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCNOP22674 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCNOP22674 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCNOP22674 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCNOP22674 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCNOP22674 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCNOP22674 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCNOP22674 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCNOP22674 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCNOP22674 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCNOP22674 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CCNOP22674 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCNOP22674 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CCNOP22674 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCNOP22674 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCNOP22674 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCNOP22674 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCNOP22674 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCNOP22674 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCNOP22674 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCNOP22674 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCNOP22674 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCNOP22674 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCNOP22674 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCNOP22674 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCNOP22674 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCNOP22674 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCNOP22674 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCNOP22674 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCNOP22674 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCNOP22674 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms