Protein–RNA interactions for Protein: P20132

SDS, L-serine dehydratase/L-threonine deaminase, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDSP20132 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
SDSP20132 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
SDSP20132 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
SDSP20132 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
SDSP20132 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
SDSP20132 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
SDSP20132 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC34.05■■■■□ 3.04
SDSP20132 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
SDSP20132 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC34.03■■■■□ 3.04
SDSP20132 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
SDSP20132 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC34.03■■■■□ 3.04
SDSP20132 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.03■■■■□ 3.04
SDSP20132 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
SDSP20132 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
SDSP20132 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
SDSP20132 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
SDSP20132 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
SDSP20132 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
SDSP20132 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
SDSP20132 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
SDSP20132 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC33.97■■■■□ 3.03
SDSP20132 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC33.96■■■■□ 3.03
SDSP20132 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
SDSP20132 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
SDSP20132 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
SDSP20132 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
SDSP20132 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
SDSP20132 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
SDSP20132 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
SDSP20132 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
SDSP20132 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
SDSP20132 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
SDSP20132 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
SDSP20132 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
SDSP20132 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
SDSP20132 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
SDSP20132 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
SDSP20132 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC33.83■■■■□ 3.01
SDSP20132 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
SDSP20132 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
SDSP20132 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
SDSP20132 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
SDSP20132 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
SDSP20132 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC33.76■■■■□ 3
SDSP20132 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
SDSP20132 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
SDSP20132 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
SDSP20132 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
SDSP20132 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC33.75■■■□□ 2.99
SDSP20132 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
SDSP20132 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
SDSP20132 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
SDSP20132 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
SDSP20132 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
SDSP20132 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
SDSP20132 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
SDSP20132 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
SDSP20132 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
SDSP20132 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
SDSP20132 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
SDSP20132 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
SDSP20132 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
SDSP20132 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
SDSP20132 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
SDSP20132 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
SDSP20132 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
SDSP20132 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC33.59■■■□□ 2.97
SDSP20132 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
SDSP20132 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
SDSP20132 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
SDSP20132 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
SDSP20132 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
SDSP20132 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
SDSP20132 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
SDSP20132 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.95
SDSP20132 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
SDSP20132 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
SDSP20132 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
SDSP20132 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
SDSP20132 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
SDSP20132 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
SDSP20132 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
SDSP20132 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
SDSP20132 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
SDSP20132 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
SDSP20132 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
SDSP20132 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
SDSP20132 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC33.41■■■□□ 2.94
SDSP20132 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
SDSP20132 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
SDSP20132 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
SDSP20132 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
SDSP20132 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
SDSP20132 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC33.37■■■□□ 2.93
SDSP20132 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
SDSP20132 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
SDSP20132 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
SDSP20132 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC33.35■■■□□ 2.93
SDSP20132 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
SDSP20132 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms