Protein–RNA interactions for Protein: P19793

RXRA, Retinoic acid receptor RXR-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RXRAP19793 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
RXRAP19793 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
RXRAP19793 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
RXRAP19793 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
RXRAP19793 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
RXRAP19793 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
RXRAP19793 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
RXRAP19793 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
RXRAP19793 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
RXRAP19793 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC32.51■■■□□ 2.79
RXRAP19793 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
RXRAP19793 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
RXRAP19793 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
RXRAP19793 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
RXRAP19793 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
RXRAP19793 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
RXRAP19793 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
RXRAP19793 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
RXRAP19793 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
RXRAP19793 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
RXRAP19793 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
RXRAP19793 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
RXRAP19793 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC32.41■■■□□ 2.78
RXRAP19793 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC32.4■■■□□ 2.78
RXRAP19793 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
RXRAP19793 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC32.4■■■□□ 2.78
RXRAP19793 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
RXRAP19793 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
RXRAP19793 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
RXRAP19793 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC32.37■■■□□ 2.77
RXRAP19793 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
RXRAP19793 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
RXRAP19793 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
RXRAP19793 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC32.31■■■□□ 2.76
RXRAP19793 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
RXRAP19793 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
RXRAP19793 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC32.3■■■□□ 2.76
RXRAP19793 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
RXRAP19793 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC32.29■■■□□ 2.76
RXRAP19793 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
RXRAP19793 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
RXRAP19793 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
RXRAP19793 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
RXRAP19793 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
RXRAP19793 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC32.22■■■□□ 2.75
RXRAP19793 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
RXRAP19793 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC32.21■■■□□ 2.75
RXRAP19793 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
RXRAP19793 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
RXRAP19793 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
RXRAP19793 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
RXRAP19793 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
RXRAP19793 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
RXRAP19793 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
RXRAP19793 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
RXRAP19793 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
RXRAP19793 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.73
RXRAP19793 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC32.13■■■□□ 2.73
RXRAP19793 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
RXRAP19793 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
RXRAP19793 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
RXRAP19793 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
RXRAP19793 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
RXRAP19793 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
RXRAP19793 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
RXRAP19793 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
RXRAP19793 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
RXRAP19793 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
RXRAP19793 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
RXRAP19793 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
RXRAP19793 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC32.07■■■□□ 2.72
RXRAP19793 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC32.06■■■□□ 2.72
RXRAP19793 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
RXRAP19793 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
RXRAP19793 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
RXRAP19793 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
RXRAP19793 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
RXRAP19793 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
RXRAP19793 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
RXRAP19793 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
RXRAP19793 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
RXRAP19793 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
RXRAP19793 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
RXRAP19793 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
RXRAP19793 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
RXRAP19793 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
RXRAP19793 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
RXRAP19793 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
RXRAP19793 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC31.91■■■□□ 2.7
RXRAP19793 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
RXRAP19793 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
RXRAP19793 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
RXRAP19793 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC31.89■■■□□ 2.7
RXRAP19793 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.69
RXRAP19793 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
RXRAP19793 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
RXRAP19793 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
RXRAP19793 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.88■■■□□ 2.69
RXRAP19793 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC31.88■■■□□ 2.69
RXRAP19793 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.9 ms