Protein–RNA interactions for Protein: P19793

RXRA, Retinoic acid receptor RXR-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RXRAP19793 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC39.96■■■■□ 3.99
RXRAP19793 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.44■■■■□ 3.9
RXRAP19793 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC38.97■■■■□ 3.83
RXRAP19793 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.91■■■■□ 3.82
RXRAP19793 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
RXRAP19793 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
RXRAP19793 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC38.31■■■■□ 3.72
RXRAP19793 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC38.18■■■■□ 3.7
RXRAP19793 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC38.08■■■■□ 3.69
RXRAP19793 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC37.92■■■■□ 3.66
RXRAP19793 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
RXRAP19793 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC37.71■■■■□ 3.63
RXRAP19793 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.46■■■■□ 3.59
RXRAP19793 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.35■■■■□ 3.57
RXRAP19793 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
RXRAP19793 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC37.02■■■■□ 3.52
RXRAP19793 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC36.85■■■■□ 3.49
RXRAP19793 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
RXRAP19793 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.8■■■■□ 3.48
RXRAP19793 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC36.79■■■■□ 3.48
RXRAP19793 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.67■■■■□ 3.46
RXRAP19793 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
RXRAP19793 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC36.49■■■■□ 3.43
RXRAP19793 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.43
RXRAP19793 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
RXRAP19793 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC36.27■■■■□ 3.4
RXRAP19793 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
RXRAP19793 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
RXRAP19793 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
RXRAP19793 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
RXRAP19793 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.34
RXRAP19793 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.32
RXRAP19793 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
RXRAP19793 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
RXRAP19793 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
RXRAP19793 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
RXRAP19793 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
RXRAP19793 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
RXRAP19793 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
RXRAP19793 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
RXRAP19793 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
RXRAP19793 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC35.6■■■■□ 3.29
RXRAP19793 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
RXRAP19793 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC35.47■■■■□ 3.27
RXRAP19793 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC35.46■■■■□ 3.27
RXRAP19793 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
RXRAP19793 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
RXRAP19793 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
RXRAP19793 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
RXRAP19793 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
RXRAP19793 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC35.16■■■■□ 3.22
RXRAP19793 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
RXRAP19793 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
RXRAP19793 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
RXRAP19793 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC34.99■■■■□ 3.19
RXRAP19793 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
RXRAP19793 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
RXRAP19793 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
RXRAP19793 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
RXRAP19793 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
RXRAP19793 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.14
RXRAP19793 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
RXRAP19793 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
RXRAP19793 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
RXRAP19793 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
RXRAP19793 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC34.61■■■■□ 3.13
RXRAP19793 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
RXRAP19793 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
RXRAP19793 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
RXRAP19793 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
RXRAP19793 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
RXRAP19793 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
RXRAP19793 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
RXRAP19793 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC34.48■■■■□ 3.11
RXRAP19793 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
RXRAP19793 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
RXRAP19793 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.1
RXRAP19793 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
RXRAP19793 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
RXRAP19793 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
RXRAP19793 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
RXRAP19793 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
RXRAP19793 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
RXRAP19793 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
RXRAP19793 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
RXRAP19793 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
RXRAP19793 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
RXRAP19793 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
RXRAP19793 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
RXRAP19793 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
RXRAP19793 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
RXRAP19793 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
RXRAP19793 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
RXRAP19793 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
RXRAP19793 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
RXRAP19793 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
RXRAP19793 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
RXRAP19793 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC33.83■■■■□ 3.01
RXRAP19793 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
RXRAP19793 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms