Protein–RNA interactions for Protein: P13866

SLC5A1, Sodium/glucose cotransporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A1P13866 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
SLC5A1P13866 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC34.26■■■■□ 3.08
SLC5A1P13866 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
SLC5A1P13866 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
SLC5A1P13866 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
SLC5A1P13866 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
SLC5A1P13866 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
SLC5A1P13866 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
SLC5A1P13866 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
SLC5A1P13866 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
SLC5A1P13866 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
SLC5A1P13866 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
SLC5A1P13866 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
SLC5A1P13866 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
SLC5A1P13866 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
SLC5A1P13866 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
SLC5A1P13866 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
SLC5A1P13866 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
SLC5A1P13866 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
SLC5A1P13866 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
SLC5A1P13866 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.08■■■■□ 3.05
SLC5A1P13866 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
SLC5A1P13866 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
SLC5A1P13866 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
SLC5A1P13866 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
SLC5A1P13866 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC34.05■■■■□ 3.04
SLC5A1P13866 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
SLC5A1P13866 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
SLC5A1P13866 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
SLC5A1P13866 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
SLC5A1P13866 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
SLC5A1P13866 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
SLC5A1P13866 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC33.98■■■■□ 3.03
SLC5A1P13866 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
SLC5A1P13866 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
SLC5A1P13866 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC33.95■■■■□ 3.03
SLC5A1P13866 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
SLC5A1P13866 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
SLC5A1P13866 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
SLC5A1P13866 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
SLC5A1P13866 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
SLC5A1P13866 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC33.9■■■■□ 3.02
SLC5A1P13866 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
SLC5A1P13866 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
SLC5A1P13866 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
SLC5A1P13866 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
SLC5A1P13866 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
SLC5A1P13866 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
SLC5A1P13866 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
SLC5A1P13866 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
SLC5A1P13866 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
SLC5A1P13866 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
SLC5A1P13866 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
SLC5A1P13866 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
SLC5A1P13866 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
SLC5A1P13866 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
SLC5A1P13866 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC33.76■■■□□ 2.99
SLC5A1P13866 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
SLC5A1P13866 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
SLC5A1P13866 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
SLC5A1P13866 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
SLC5A1P13866 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
SLC5A1P13866 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
SLC5A1P13866 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
SLC5A1P13866 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
SLC5A1P13866 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
SLC5A1P13866 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
SLC5A1P13866 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
SLC5A1P13866 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
SLC5A1P13866 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
SLC5A1P13866 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
SLC5A1P13866 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
SLC5A1P13866 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
SLC5A1P13866 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
SLC5A1P13866 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
SLC5A1P13866 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
SLC5A1P13866 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
SLC5A1P13866 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
SLC5A1P13866 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
SLC5A1P13866 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
SLC5A1P13866 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
SLC5A1P13866 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC33.57■■■□□ 2.97
SLC5A1P13866 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
SLC5A1P13866 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
SLC5A1P13866 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
SLC5A1P13866 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
SLC5A1P13866 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC33.54■■■□□ 2.96
SLC5A1P13866 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
SLC5A1P13866 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
SLC5A1P13866 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
SLC5A1P13866 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
SLC5A1P13866 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
SLC5A1P13866 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
SLC5A1P13866 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
SLC5A1P13866 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
SLC5A1P13866 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
SLC5A1P13866 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
SLC5A1P13866 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC33.47■■■□□ 2.95
SLC5A1P13866 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
SLC5A1P13866 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms